77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4377 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  59.71 
 
 		 684 aa  718    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  65.72 
 
 		 664 aa  793    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 641 aa  1286    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  61.11 
 
 		 684 aa  769    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  44.74 
 
 		 723 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  35.21 
 
 		 607 aa  298  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.19 
 
 		 629 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  27.6 
 
 		 610 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.6 
 
 		 610 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.6 
 
 		 610 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  27.6 
 
 		 610 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.36 
 
 		 610 aa  137  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.44 
 
 		 610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  27.44 
 
 		 610 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  27.55 
 
 		 658 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1948  outer membrane autotransporter  26.15 
 
 		 627 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  26.08 
 
 		 594 aa  96.3  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  24.53 
 
 		 630 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  22.28 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.95 
 
 		 774 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  23.2 
 
 		 640 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  23.8 
 
 		 636 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  26.61 
 
 		 1369 aa  74.3  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  22.25 
 
 		 629 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.35 
 
 		 1489 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.42 
 
 		 1673 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  21.93 
 
 		 646 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  21.02 
 
 		 646 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  21.49 
 
 		 629 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  21.22 
 
 		 629 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  25.91 
 
 		 939 aa  70.1  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  21.93 
 
 		 626 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  23.59 
 
 		 597 aa  67  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  26.88 
 
 		 1672 aa  67  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  23.71 
 
 		 1222 aa  66.6  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  28.35 
 
 		 1769 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  24.01 
 
 		 597 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  25.37 
 
 		 1012 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  29.32 
 
 		 1886 aa  63.9  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  24.86 
 
 		 662 aa  63.9  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  25.94 
 
 		 985 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  25.48 
 
 		 972 aa  62.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  25 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.53 
 
 		 617 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  23.11 
 
 		 763 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  26.38 
 
 		 647 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  24.66 
 
 		 759 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  24.4 
 
 		 329 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  24.4 
 
 		 329 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  25.79 
 
 		 647 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  23.33 
 
 		 628 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  24.4 
 
 		 1025 aa  58.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  26.76 
 
 		 1782 aa  55.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  26.94 
 
 		 1078 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  27.75 
 
 		 994 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  26.04 
 
 		 1068 aa  53.9  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  23.24 
 
 		 814 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  22.82 
 
 		 728 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  22.82 
 
 		 728 aa  51.2  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  22.82 
 
 		 728 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  29.76 
 
 		 1177 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.2 
 
 		 330 aa  50.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2143  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.66 
 
 		 650 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  24.07 
 
 		 1019 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  28.42 
 
 		 1016 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  24.07 
 
 		 2407 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5647  hypothetical protein  25.99 
 
 		 307 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  25.18 
 
 		 2848 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  38.46 
 
 		 310 aa  48.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  26.67 
 
 		 983 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  22.53 
 
 		 284 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  25.74 
 
 		 1179 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  26.06 
 
 		 1333 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64990  hypothetical protein  25.33 
 
 		 307 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  27.23 
 
 		 714 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  21.79 
 
 		 488 aa  44.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.78 
 
 		 913 aa  44.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>