106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3895 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  97.12 
 
 		 1526 aa  2850    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  97.25 
 
 		 1526 aa  2864    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  95.23 
 
 		 1565 aa  2872    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  100 
 
 		 1571 aa  3152    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  41.69 
 
 		 836 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.69 
 
 		 836 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  41.69 
 
 		 863 aa  627  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  41.69 
 
 		 863 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  41.69 
 
 		 836 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  41.95 
 
 		 863 aa  618  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  97.46 
 
 		 236 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  51.16 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  34.05 
 
 		 769 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  32.81 
 
 		 731 aa  248  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  32.42 
 
 		 732 aa  242  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  34 
 
 		 709 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  28.26 
 
 		 1441 aa  239  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  32.14 
 
 		 773 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  28.59 
 
 		 1541 aa  233  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  31.93 
 
 		 1008 aa  229  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  31.26 
 
 		 730 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  33.26 
 
 		 638 aa  227  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  33.26 
 
 		 638 aa  227  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  32.1 
 
 		 733 aa  226  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  31.58 
 
 		 729 aa  226  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  33.05 
 
 		 638 aa  224  9e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  96.3 
 
 		 108 aa  224  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  97.37 
 
 		 136 aa  222  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  96.3 
 
 		 108 aa  222  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  30.59 
 
 		 759 aa  221  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  30.59 
 
 		 759 aa  220  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  30.94 
 
 		 759 aa  215  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  31.72 
 
 		 747 aa  208  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  27.34 
 
 		 1117 aa  198  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  27.56 
 
 		 562 aa  195  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  26.82 
 
 		 800 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  29.1 
 
 		 815 aa  162  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  34.69 
 
 		 948 aa  147  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01148  hypothetical protein  95.71 
 
 		 70 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.231444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1273  hypothetical protein  95.71 
 
 		 70 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01158  hypothetical protein  95.71 
 
 		 70 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.207051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  34.69 
 
 		 948 aa  138  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  34.62 
 
 		 949 aa  138  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2139  antigen 43, truncation  35 
 
 		 583 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.34 
 
 		 1039 aa  135  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  33.1 
 
 		 948 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1533  hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  107  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  hitchhiker  0.00188577 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1976  conserved hypothetical protein  28.78 
 
 		 418 aa  105  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000418237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1744  hypothetical protein  28.78 
 
 		 418 aa  105  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1965  hypothetical protein  28.78 
 
 		 418 aa  105  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.646442  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2377  hypothetical protein  28.78 
 
 		 418 aa  105  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000029957  normal  0.0111859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1878  hypothetical protein  28.78 
 
 		 418 aa  105  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000220122  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1862  hypothetical protein  28.78 
 
 		 418 aa  105  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000261063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01635  hypothetical protein  28.29 
 
 		 418 aa  102  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.629129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01625  hypothetical protein  28.29 
 
 		 418 aa  102  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  24.65 
 
 		 765 aa  87  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01157  hypothetical protein  94.87 
 
 		 73 aa  83.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  24.92 
 
 		 714 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  24.36 
 
 		 470 aa  76.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  23.92 
 
 		 680 aa  75.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  25.57 
 
 		 681 aa  75.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  25.49 
 
 		 1003 aa  75.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  25.08 
 
 		 868 aa  73.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  26.97 
 
 		 1099 aa  73.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  26.08 
 
 		 1093 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  26.08 
 
 		 1093 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 		 1000 aa  71.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 		 465 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 		 922 aa  70.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  25.25 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 		 968 aa  68.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  25.5 
 
 		 968 aa  68.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  24.24 
 
 		 1594 aa  64.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  40.23 
 
 		 268 aa  63.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  24.1 
 
 		 2906 aa  60.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  23.91 
 
 		 1579 aa  60.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  24.1 
 
 		 2578 aa  60.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  24.1 
 
 		 1861 aa  59.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  26.29 
 
 		 1369 aa  58.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  35.96 
 
 		 480 aa  57.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  23.81 
 
 		 1806 aa  57.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  24.66 
 
 		 1108 aa  56.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  24.52 
 
 		 1327 aa  56.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  41.38 
 
 		 484 aa  56.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  45.45 
 
 		 489 aa  56.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  25.7 
 
 		 950 aa  55.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  24.78 
 
 		 1113 aa  55.5  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1287  pertactin  28.04 
 
 		 454 aa  53.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  41.79 
 
 		 928 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  23.45 
 
 		 1004 aa  50.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  23.79 
 
 		 997 aa  50.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  42.22 
 
 		 489 aa  49.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  30.43 
 
 		 358 aa  49.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  26.34 
 
 		 1012 aa  48.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  42.22 
 
 		 501 aa  48.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  33.66 
 
 		 1593 aa  48.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  42.86 
 
 		 489 aa  48.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  24.24 
 
 		 466 aa  48.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  30.87 
 
 		 358 aa  48.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.12 
 
 		 3322 aa  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>