29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1273 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  95.71 
 
 		 1571 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01148  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.231444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01158  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.207051  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1273  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  143  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  92.86 
 
 		 1565 aa  140  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  91.43 
 
 		 1526 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  91.43 
 
 		 1526 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  92.86 
 
 		 108 aa  135  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  92.86 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  92.86 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  91.43 
 
 		 236 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  61.43 
 
 		 863 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  60 
 
 		 836 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  60 
 
 		 863 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  60 
 
 		 863 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  60 
 
 		 836 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  60 
 
 		 836 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  60 
 
 		 429 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  44.78 
 
 		 732 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  42.42 
 
 		 731 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  41.18 
 
 		 1008 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  45.45 
 
 		 773 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  40.91 
 
 		 733 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  38.81 
 
 		 730 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  31.88 
 
 		 800 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  37.31 
 
 		 729 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  38.24 
 
 		 769 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  35.71 
 
 		 709 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  27.94 
 
 		 815 aa  40  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>