42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1976 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  96.3 
 
 		 1571 aa  223  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  97.22 
 
 		 1565 aa  221  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  220  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  94.44 
 
 		 1526 aa  215  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  94.44 
 
 		 1526 aa  215  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  94.44 
 
 		 108 aa  210  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  94.44 
 
 		 236 aa  208  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  93.52 
 
 		 136 aa  207  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01148  hypothetical protein  92.86 
 
 		 70 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.231444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01158  hypothetical protein  92.86 
 
 		 70 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.207051  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  59.8 
 
 		 863 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1273  hypothetical protein  92.86 
 
 		 70 aa  135  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  58.82 
 
 		 863 aa  133  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  58.82 
 
 		 863 aa  133  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  58.82 
 
 		 836 aa  133  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  58.82 
 
 		 836 aa  133  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  58.82 
 
 		 836 aa  133  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  58.82 
 
 		 429 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  44 
 
 		 731 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  42 
 
 		 732 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  44 
 
 		 773 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  40.86 
 
 		 1008 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  36.11 
 
 		 730 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  39.22 
 
 		 729 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  37.04 
 
 		 769 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  37 
 
 		 733 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01157  hypothetical protein  90.91 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206083  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  34.26 
 
 		 709 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  34 
 
 		 759 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  35.35 
 
 		 638 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  34 
 
 		 759 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  34 
 
 		 759 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  35.35 
 
 		 638 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  35.35 
 
 		 638 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  31.73 
 
 		 800 aa  56.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  34.02 
 
 		 1117 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  34.02 
 
 		 562 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  36.63 
 
 		 747 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  33.33 
 
 		 1541 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  33.33 
 
 		 1441 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  25.25 
 
 		 815 aa  48.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  28.87 
 
 		 765 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>