110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2773 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  94.23 
 
 		 1526 aa  2748    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  94.3 
 
 		 1526 aa  2761    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  100 
 
 		 1565 aa  3141    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  95.16 
 
 		 1571 aa  2871    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  41.25 
 
 		 836 aa  625  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.25 
 
 		 836 aa  625  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  41.25 
 
 		 836 aa  625  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  41.25 
 
 		 863 aa  625  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  41.25 
 
 		 863 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  41.52 
 
 		 863 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  96.61 
 
 		 236 aa  479  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  53.17 
 
 		 429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  32.06 
 
 		 732 aa  240  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  32.34 
 
 		 731 aa  239  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  33.26 
 
 		 769 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  28.51 
 
 		 1441 aa  238  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  31.98 
 
 		 773 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  28.08 
 
 		 1541 aa  233  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  33.18 
 
 		 709 aa  232  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  33.33 
 
 		 638 aa  229  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 638 aa  229  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  31.99 
 
 		 1008 aa  227  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  33.12 
 
 		 638 aa  226  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  31.63 
 
 		 729 aa  227  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  30.87 
 
 		 730 aa  222  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  30.63 
 
 		 759 aa  220  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  97.22 
 
 		 108 aa  220  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  95.37 
 
 		 108 aa  219  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  30.63 
 
 		 759 aa  219  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  94.74 
 
 		 136 aa  218  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  31.33 
 
 		 733 aa  217  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  31.28 
 
 		 759 aa  215  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  31.57 
 
 		 747 aa  201  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  27.52 
 
 		 1117 aa  199  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 		 562 aa  194  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  27.08 
 
 		 800 aa  185  7e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  26.89 
 
 		 815 aa  166  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  33.25 
 
 		 948 aa  145  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  33.49 
 
 		 948 aa  142  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01148  hypothetical protein  92.86 
 
 		 70 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.231444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01158  hypothetical protein  92.86 
 
 		 70 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.207051  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1273  hypothetical protein  92.86 
 
 		 70 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  35.35 
 
 		 949 aa  139  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2139  antigen 43, truncation  33.25 
 
 		 583 aa  138  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  33.25 
 
 		 948 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.91 
 
 		 1039 aa  131  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1533  hypothetical protein  29.28 
 
 		 418 aa  109  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  hitchhiker  0.00188577 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1976  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  107  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000418237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1744  hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  107  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153793  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1878  hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  107  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000220122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1965  hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  107  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.646442  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1862  hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  107  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000261063  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2377  hypothetical protein  29.03 
 
 		 418 aa  107  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000029957  normal  0.0111859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01635  hypothetical protein  28.54 
 
 		 418 aa  104  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.629129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01625  hypothetical protein  28.54 
 
 		 418 aa  104  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  25.35 
 
 		 765 aa  87.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01157  hypothetical protein  94.87 
 
 		 73 aa  83.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206083  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  24.53 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  24.92 
 
 		 714 aa  75.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  24.17 
 
 		 680 aa  75.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  25.49 
 
 		 1003 aa  74.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  24.53 
 
 		 681 aa  75.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  25.33 
 
 		 868 aa  73.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  27.89 
 
 		 1093 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  27.89 
 
 		 1093 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 		 1000 aa  70.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 		 922 aa  68.6  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 		 968 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  22.92 
 
 		 955 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  25.5 
 
 		 968 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  22.92 
 
 		 955 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.8 
 
 		 955 aa  67.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  25.5 
 
 		 398 aa  67.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  26.62 
 
 		 1099 aa  65.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  24.39 
 
 		 2906 aa  63.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  24.39 
 
 		 2578 aa  62.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  23.76 
 
 		 1594 aa  61.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  24.39 
 
 		 1861 aa  61.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  21.96 
 
 		 1602 aa  60.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  24.18 
 
 		 1806 aa  59.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  24.59 
 
 		 1108 aa  58.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  24.45 
 
 		 1327 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  23.13 
 
 		 1579 aa  57.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  41.56 
 
 		 268 aa  57.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  23.89 
 
 		 1113 aa  57  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  26.64 
 
 		 1369 aa  57  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  23.97 
 
 		 950 aa  56.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  35.96 
 
 		 480 aa  55.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  46.81 
 
 		 489 aa  53.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  53.85 
 
 		 928 aa  53.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  31.11 
 
 		 444 aa  52.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  47.73 
 
 		 484 aa  52  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  22.37 
 
 		 961 aa  51.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  23.62 
 
 		 997 aa  51.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  23.97 
 
 		 1004 aa  51.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  24.39 
 
 		 466 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  24.51 
 
 		 1770 aa  50.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  42.22 
 
 		 489 aa  49.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  33.66 
 
 		 1593 aa  49.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>