38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2139 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  78.13 
 
 		 1039 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  82.75 
 
 		 949 aa  888    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  91.1 
 
 		 948 aa  1003    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2139  antigen 43, truncation  100 
 
 		 583 aa  1125    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  96.34 
 
 		 948 aa  1055    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  97.03 
 
 		 948 aa  1067    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1571 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  34.69 
 
 		 1526 aa  138  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.69 
 
 		 1526 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1565 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  36.64 
 
 		 863 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  35.5 
 
 		 863 aa  115  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  35.5 
 
 		 836 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  35.5 
 
 		 836 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  35.5 
 
 		 863 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.5 
 
 		 836 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1976  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000418237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2377  hypothetical protein  35.57 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000029957  normal  0.0111859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1878  hypothetical protein  40 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000220122  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1862  hypothetical protein  40 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000261063  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1744  hypothetical protein  40 
 
 		 418 aa  92  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1965  hypothetical protein  40 
 
 		 418 aa  92  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.646442  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01635  hypothetical protein  40 
 
 		 418 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.629129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01625  hypothetical protein  40 
 
 		 418 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1533  hypothetical protein  35.57 
 
 		 418 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  hitchhiker  0.00188577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  45.33 
 
 		 3635 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  29.65 
 
 		 815 aa  48.9  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  41.38 
 
 		 1472 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  52.5 
 
 		 2396 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  28.19 
 
 		 1770 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  38.98 
 
 		 1446 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  43.1 
 
 		 3322 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  29.73 
 
 		 1770 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1422  hypothetical protein  21.05 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.956328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  51.28 
 
 		 5613 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  30.04 
 
 		 1748 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.45 
 
 		 985 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1287  pertactin  26.92 
 
 		 454 aa  43.5  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>