129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0568 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  85.4 
 
 		 1753 aa  2857    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  83.6 
 
 		 1762 aa  2764    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1770 aa  3415    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  83.6 
 
 		 1762 aa  2764    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  80.27 
 
 		 1748 aa  2655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  83.27 
 
 		 1763 aa  2765    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  96.95 
 
 		 1770 aa  3180    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  40.53 
 
 		 1594 aa  555  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  39.39 
 
 		 1579 aa  535  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  30.72 
 
 		 1067 aa  320  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  29.93 
 
 		 2637 aa  310  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  32.36 
 
 		 1070 aa  309  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  32.05 
 
 		 1070 aa  308  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  33 
 
 		 1040 aa  267  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  32.58 
 
 		 947 aa  256  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.88 
 
 		 1023 aa  254  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  35.56 
 
 		 1099 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  33.79 
 
 		 1115 aa  219  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  32.57 
 
 		 1093 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  32.57 
 
 		 1093 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  29.99 
 
 		 1234 aa  192  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  26.12 
 
 		 820 aa  186  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  32.14 
 
 		 924 aa  167  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  30.98 
 
 		 995 aa  159  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  28.85 
 
 		 818 aa  146  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  29.51 
 
 		 825 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  29.27 
 
 		 819 aa  140  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  31.07 
 
 		 1593 aa  136  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  28.65 
 
 		 950 aa  135  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  29.67 
 
 		 864 aa  134  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  34.58 
 
 		 1049 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  26.6 
 
 		 1008 aa  130  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  30.09 
 
 		 1012 aa  129  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  33.19 
 
 		 2926 aa  127  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.86 
 
 		 1357 aa  125  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  32.31 
 
 		 909 aa  123  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  27.97 
 
 		 1741 aa  123  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  28.96 
 
 		 1571 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  26.97 
 
 		 730 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  30.15 
 
 		 1277 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.46 
 
 		 1055 aa  119  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  29.92 
 
 		 948 aa  115  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  29.14 
 
 		 949 aa  114  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  29.83 
 
 		 1108 aa  113  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.99 
 
 		 1009 aa  110  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  28.55 
 
 		 729 aa  110  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.85 
 
 		 1039 aa  108  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  27.44 
 
 		 1068 aa  106  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  29.19 
 
 		 4391 aa  106  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  29.19 
 
 		 4312 aa  106  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  27.16 
 
 		 709 aa  105  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  30.88 
 
 		 2057 aa  104  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  30.08 
 
 		 948 aa  105  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.03 
 
 		 1086 aa  104  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  28.3 
 
 		 1259 aa  103  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  29.25 
 
 		 1268 aa  103  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  29.06 
 
 		 1254 aa  103  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  28.66 
 
 		 948 aa  102  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  26.5 
 
 		 731 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  29.06 
 
 		 1269 aa  100  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  28.66 
 
 		 1285 aa  99.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  28.66 
 
 		 1259 aa  99  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  26.25 
 
 		 732 aa  99  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.63 
 
 		 868 aa  98.2  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.35 
 
 		 1327 aa  98.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  28.27 
 
 		 1806 aa  98.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  35.71 
 
 		 927 aa  96.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  27.81 
 
 		 769 aa  95.9  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  38.46 
 
 		 914 aa  95.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.25 
 
 		 806 aa  93.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  26.12 
 
 		 773 aa  91.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  28.39 
 
 		 989 aa  90.5  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  26.02 
 
 		 733 aa  90.5  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  25.07 
 
 		 773 aa  88.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  24.71 
 
 		 1602 aa  84.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  31.29 
 
 		 1626 aa  84.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0051  hypothetical protein  31.51 
 
 		 508 aa  83.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  28.48 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  25.13 
 
 		 747 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1165 aa  80.1  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1165 aa  80.1  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  38.41 
 
 		 955 aa  80.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  29.48 
 
 		 506 aa  79.7  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  31.6 
 
 		 861 aa  79  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  27.16 
 
 		 1327 aa  79  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  38.41 
 
 		 955 aa  78.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  26.74 
 
 		 1327 aa  78.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  27.04 
 
 		 1349 aa  77.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  29.48 
 
 		 506 aa  77.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.57 
 
 		 1197 aa  73.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  43.31 
 
 		 3322 aa  72.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  32.78 
 
 		 1102 aa  66.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0169  hypothetical protein  30.27 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.559059  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  26.55 
 
 		 1252 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  28.31 
 
 		 997 aa  60.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  28.31 
 
 		 1004 aa  59.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  44.44 
 
 		 1546 aa  59.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  31.78 
 
 		 1234 aa  59.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.1 
 
 		 1234 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  25.97 
 
 		 389 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>