115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0734 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
1086 aa  2165    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  36 
 
 
1594 aa  303  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.92 
 
 
806 aa  300  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.4 
 
 
868 aa  294  7e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  32.87 
 
 
1579 aa  276  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  35.42 
 
 
989 aa  266  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  28.53 
 
 
1234 aa  265  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  34.45 
 
 
4391 aa  265  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  34.45 
 
 
4312 aa  261  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  34.8 
 
 
3322 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  35.22 
 
 
2637 aa  256  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  34.57 
 
 
1327 aa  249  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  34.57 
 
 
1327 aa  249  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  34.57 
 
 
1349 aa  249  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  28.57 
 
 
773 aa  249  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  33.07 
 
 
1806 aa  239  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  32.67 
 
 
1327 aa  235  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  33.33 
 
 
466 aa  224  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  32.3 
 
 
2057 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  33.81 
 
 
1277 aa  214  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  29.31 
 
 
1102 aa  213  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  30.6 
 
 
1165 aa  191  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  30.6 
 
 
1165 aa  191  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  29.6 
 
 
995 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.08 
 
 
1023 aa  172  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  31.88 
 
 
955 aa  165  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  29.26 
 
 
1004 aa  164  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  31.71 
 
 
955 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  27.6 
 
 
997 aa  156  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.33 
 
 
1067 aa  155  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  34.3 
 
 
1626 aa  150  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  32.71 
 
 
338 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  31.54 
 
 
1234 aa  142  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  26.85 
 
 
1753 aa  141  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  35.17 
 
 
306 aa  141  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  27.61 
 
 
1250 aa  140  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.33 
 
 
1234 aa  140  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  23.8 
 
 
1070 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  30.69 
 
 
1252 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  29.94 
 
 
2926 aa  139  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  25.22 
 
 
1070 aa  139  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  31.12 
 
 
1234 aa  138  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  28.09 
 
 
1040 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  30.61 
 
 
950 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  26.68 
 
 
1748 aa  134  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  29.64 
 
 
3415 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  30.71 
 
 
1250 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  29.38 
 
 
3420 aa  133  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  28.48 
 
 
818 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  30.91 
 
 
1254 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  30.05 
 
 
1012 aa  128  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  29.94 
 
 
1108 aa  127  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  29.94 
 
 
1028 aa  126  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  26.06 
 
 
1770 aa  125  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  29.18 
 
 
1571 aa  124  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  29.8 
 
 
825 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  31.39 
 
 
2906 aa  121  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  29.06 
 
 
819 aa  121  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  26.01 
 
 
1762 aa  121  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  26.01 
 
 
1762 aa  121  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  31.02 
 
 
2578 aa  120  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  29.48 
 
 
1049 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  28.52 
 
 
947 aa  119  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  30.34 
 
 
1861 aa  118  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  25.83 
 
 
1763 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  52.38 
 
 
1068 aa  115  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  29.03 
 
 
909 aa  115  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  28.83 
 
 
1593 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  29.06 
 
 
1113 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  26.53 
 
 
1770 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  26.53 
 
 
1008 aa  112  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.04 
 
 
1741 aa  105  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  33.72 
 
 
861 aa  101  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  29.88 
 
 
1254 aa  97.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  29.64 
 
 
1259 aa  95.5  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  29.64 
 
 
1269 aa  94  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  34.74 
 
 
1093 aa  93.2  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  34.74 
 
 
1093 aa  93.2  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.85 
 
 
1009 aa  93.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  29.4 
 
 
1259 aa  92.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  28.92 
 
 
1268 aa  91.3  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  28.92 
 
 
1285 aa  90.9  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  27.87 
 
 
1099 aa  91.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  40 
 
 
927 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  41.46 
 
 
506 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  41.46 
 
 
506 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  30.12 
 
 
914 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  24.01 
 
 
709 aa  71.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  37.21 
 
 
924 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.14 
 
 
769 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  24.5 
 
 
732 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  31.02 
 
 
1115 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  37.17 
 
 
864 aa  60.1  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  26.32 
 
 
638 aa  57.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  25.94 
 
 
638 aa  56.2  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  25.94 
 
 
638 aa  56.2  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  24.74 
 
 
773 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  25.74 
 
 
747 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  25.65 
 
 
733 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.49 
 
 
870 aa  53.5  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>