117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0561 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  97.21 
 
 		 1004 aa  1989    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 997 aa  2038    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  42.9 
 
 		 4312 aa  298  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  42.9 
 
 		 4391 aa  297  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  39.61 
 
 		 1594 aa  280  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  40.74 
 
 		 1327 aa  280  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  42.32 
 
 		 955 aa  279  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  40.43 
 
 		 1327 aa  278  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  40.12 
 
 		 1349 aa  277  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  42.01 
 
 		 955 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  38.53 
 
 		 2637 aa  253  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.96 
 
 		 868 aa  253  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  36.8 
 
 		 1579 aa  251  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  36.26 
 
 		 1327 aa  244  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  35.99 
 
 		 1806 aa  242  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  35.64 
 
 		 466 aa  241  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  37.35 
 
 		 773 aa  234  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1165 aa  218  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1165 aa  218  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  27.13 
 
 		 3322 aa  207  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  36.51 
 
 		 338 aa  203  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  35.08 
 
 		 306 aa  196  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  33.23 
 
 		 1102 aa  191  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  30.91 
 
 		 989 aa  179  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  29.65 
 
 		 2057 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.43 
 
 		 806 aa  147  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.3 
 
 		 1086 aa  140  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  26.01 
 
 		 1234 aa  127  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  24.85 
 
 		 1277 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  39.39 
 
 		 1626 aa  112  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  25.98 
 
 		 1028 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  24.38 
 
 		 995 aa  99  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  32.71 
 
 		 1113 aa  97.4  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  26.97 
 
 		 1252 aa  91.7  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  26.72 
 
 		 1234 aa  90.9  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.72 
 
 		 1234 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  26.72 
 
 		 1250 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  27.7 
 
 		 815 aa  88.2  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  42.37 
 
 		 950 aa  87.4  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  30.95 
 
 		 861 aa  87  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.43 
 
 		 1023 aa  86.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  25.91 
 
 		 1254 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  30.34 
 
 		 1571 aa  85.9  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  25.91 
 
 		 1234 aa  85.1  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  42.02 
 
 		 1012 aa  84  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  24.9 
 
 		 1250 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  33.06 
 
 		 1593 aa  81.3  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  29.86 
 
 		 1068 aa  80.9  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  35.26 
 
 		 2926 aa  79  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  30.46 
 
 		 1254 aa  78.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  29.61 
 
 		 1268 aa  74.3  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  27.84 
 
 		 1259 aa  73.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  29.61 
 
 		 1269 aa  73.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  29.66 
 
 		 1861 aa  72.8  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  28.49 
 
 		 2906 aa  72.4  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  29.93 
 
 		 2578 aa  72  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  26 
 
 		 1108 aa  71.6  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  29.61 
 
 		 1259 aa  70.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  29.61 
 
 		 1285 aa  70.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  37.5 
 
 		 825 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  38.17 
 
 		 819 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  35.11 
 
 		 818 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  31.38 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  27.72 
 
 		 1099 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  31.38 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  31.74 
 
 		 1040 aa  67  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  30.12 
 
 		 1763 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  37.17 
 
 		 3420 aa  65.9  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  29.63 
 
 		 1067 aa  65.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  29.17 
 
 		 1748 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  24.78 
 
 		 800 aa  65.5  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  37.17 
 
 		 3415 aa  65.1  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  30.52 
 
 		 1070 aa  65.1  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  32.95 
 
 		 1070 aa  65.1  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  29.52 
 
 		 1762 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  29.52 
 
 		 1762 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  24.04 
 
 		 773 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  25.84 
 
 		 733 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  29.05 
 
 		 1753 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  31.83 
 
 		 1115 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  28.92 
 
 		 1770 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  24.9 
 
 		 638 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  24.9 
 
 		 638 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  24.9 
 
 		 638 aa  60.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  28.31 
 
 		 1770 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  29.19 
 
 		 1093 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  29.19 
 
 		 1093 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.2 
 
 		 1039 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  29.19 
 
 		 765 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  24.38 
 
 		 709 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  27.54 
 
 		 947 aa  56.6  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  27.27 
 
 		 1741 aa  56.2  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  24.3 
 
 		 820 aa  55.5  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  23.93 
 
 		 759 aa  55.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.46 
 
 		 1357 aa  54.7  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  23.93 
 
 		 759 aa  54.7  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  24.03 
 
 		 769 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  32.84 
 
 		 927 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  23.93 
 
 		 759 aa  53.5  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  29.95 
 
 		 914 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>