133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3962 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  98.64 
 
 
955 aa  1909    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  100 
 
 
955 aa  1932    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  53.03 
 
 
1594 aa  574  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  44.22 
 
 
1579 aa  518  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.81 
 
 
868 aa  484  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  46.1 
 
 
1806 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  45.9 
 
 
1327 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  46.69 
 
 
466 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  58.33 
 
 
4391 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  58.64 
 
 
4312 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  55.93 
 
 
1349 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  55.62 
 
 
1327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  55.62 
 
 
1327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  52.55 
 
 
2637 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  36.05 
 
 
1165 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  36.05 
 
 
1165 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  46.63 
 
 
773 aa  325  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  45.22 
 
 
338 aa  293  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  39.23 
 
 
1004 aa  293  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  38.73 
 
 
997 aa  285  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  43.93 
 
 
306 aa  282  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  39.63 
 
 
1102 aa  264  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  45.92 
 
 
1626 aa  260  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.4 
 
 
806 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.79 
 
 
3322 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  32.94 
 
 
2057 aa  226  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  34.05 
 
 
989 aa  210  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  33.54 
 
 
1277 aa  194  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  34.15 
 
 
1234 aa  194  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  26.95 
 
 
995 aa  171  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  30.6 
 
 
1234 aa  152  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.6 
 
 
1234 aa  151  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  30.6 
 
 
1250 aa  151  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  30.6 
 
 
1234 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  30.6 
 
 
1254 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.45 
 
 
1086 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  30.28 
 
 
1252 aa  147  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  29.65 
 
 
1250 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.6 
 
 
1023 aa  140  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  32.15 
 
 
2578 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  32.46 
 
 
2906 aa  138  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  32.46 
 
 
1861 aa  137  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  30.75 
 
 
1113 aa  135  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  28.62 
 
 
1028 aa  132  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  29.39 
 
 
1012 aa  127  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  28.9 
 
 
950 aa  122  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  28.07 
 
 
1108 aa  119  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  26.97 
 
 
909 aa  115  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  26.56 
 
 
3420 aa  115  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.67 
 
 
818 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.63 
 
 
825 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  26.61 
 
 
3415 aa  112  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  26.58 
 
 
819 aa  110  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  33.68 
 
 
861 aa  105  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  26.1 
 
 
1040 aa  104  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  26.13 
 
 
2926 aa  103  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.98 
 
 
1762 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.98 
 
 
1762 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  24.09 
 
 
1770 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.29 
 
 
1009 aa  98.6  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  45.11 
 
 
506 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  45.11 
 
 
506 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  23.07 
 
 
1763 aa  96.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  23.89 
 
 
1049 aa  95.9  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  27.06 
 
 
1748 aa  95.9  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  24.48 
 
 
1770 aa  93.2  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  26.46 
 
 
1571 aa  92.8  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  24.11 
 
 
1753 aa  89.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  27.18 
 
 
773 aa  89  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  35 
 
 
1068 aa  88.6  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  26.45 
 
 
1099 aa  88.2  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  26.62 
 
 
1067 aa  84.7  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  40.3 
 
 
1593 aa  83.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  25.5 
 
 
815 aa  81.3  0.00000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  26.81 
 
 
733 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  27.87 
 
 
961 aa  79  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  24.21 
 
 
1093 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  24.21 
 
 
1093 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  26.96 
 
 
732 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  26.85 
 
 
1070 aa  76.3  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  27.21 
 
 
731 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  26.42 
 
 
1070 aa  74.7  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.29 
 
 
1115 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.65 
 
 
870 aa  72.4  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  26.75 
 
 
820 aa  71.6  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0822  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.25 
 
 
854 aa  68.6  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  27.21 
 
 
769 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  24.09 
 
 
955 aa  68.2  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  39.82 
 
 
1269 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  23.96 
 
 
955 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.96 
 
 
955 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  39.82 
 
 
1259 aa  67  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  23.96 
 
 
955 aa  67  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  25.91 
 
 
729 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  25.91 
 
 
1741 aa  66.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  25.6 
 
 
800 aa  65.9  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  31.6 
 
 
1254 aa  66.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  38.94 
 
 
1259 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  38.94 
 
 
1285 aa  65.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  38.94 
 
 
1268 aa  65.5  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>