102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1348 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  97.71 
 
 		 955 aa  1774    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  97.92 
 
 		 955 aa  1780    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  97.71 
 
 		 955 aa  1777    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  100 
 
 		 961 aa  1927    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  97.71 
 
 		 955 aa  1777    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1682  hypothetical protein  96.63 
 
 		 386 aa  695    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  26.92 
 
 		 730 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  26.31 
 
 		 709 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  28.31 
 
 		 773 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  26.54 
 
 		 729 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  26.28 
 
 		 733 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  26.68 
 
 		 732 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  27.11 
 
 		 1008 aa  123  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.44 
 
 		 769 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  25.4 
 
 		 731 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  25.43 
 
 		 747 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  25.54 
 
 		 638 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  25.54 
 
 		 638 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  25.32 
 
 		 638 aa  108  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  23.73 
 
 		 1067 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  23.92 
 
 		 800 aa  98.6  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  24.54 
 
 		 759 aa  95.5  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  24.54 
 
 		 759 aa  94.7  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  25.1 
 
 		 836 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.1 
 
 		 836 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  25.1 
 
 		 863 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  25.1 
 
 		 863 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  25.1 
 
 		 836 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  24.34 
 
 		 759 aa  92  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  24.1 
 
 		 1070 aa  87.4  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  28.1 
 
 		 1526 aa  87  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.27 
 
 		 1023 aa  86.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.52 
 
 		 868 aa  85.9  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  24.1 
 
 		 1070 aa  86.3  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  24.24 
 
 		 863 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  24.76 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  22.96 
 
 		 815 aa  84  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  26.45 
 
 		 1099 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  25.25 
 
 		 1093 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  25.25 
 
 		 1093 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  24.88 
 
 		 562 aa  81.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  26.39 
 
 		 1770 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1565 aa  79  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.92 
 
 		 1526 aa  77.8  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  26.04 
 
 		 765 aa  77.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  26.67 
 
 		 955 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  26.67 
 
 		 955 aa  77  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  23.95 
 
 		 947 aa  75.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  25.12 
 
 		 1117 aa  75.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  21.61 
 
 		 1366 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  25.51 
 
 		 1770 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  24.06 
 
 		 1300 aa  72  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  24.61 
 
 		 1541 aa  71.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  25.17 
 
 		 1441 aa  71.6  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  23.53 
 
 		 1602 aa  70.9  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  23.96 
 
 		 1579 aa  68.6  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4650  serine protease EatA  22.47 
 
 		 1285 aa  68.2  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  28.47 
 
 		 1971 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  24.71 
 
 		 3322 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  24.65 
 
 		 773 aa  65.1  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  24.1 
 
 		 2057 aa  63.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  25.11 
 
 		 1748 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.56 
 
 		 1115 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  24.39 
 
 		 1040 aa  60.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  26.1 
 
 		 1108 aa  60.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  24.67 
 
 		 995 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  23.42 
 
 		 1593 aa  59.3  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  28.18 
 
 		 1234 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.42 
 
 		 1357 aa  58.9  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  25.03 
 
 		 1763 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  53.33 
 
 		 268 aa  56.2  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3921  outer membrane autotransporter  25.45 
 
 		 1269 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.55 
 
 		 1055 aa  55.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  24.51 
 
 		 1741 aa  55.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  23 
 
 		 818 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.28 
 
 		 1009 aa  54.3  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1165 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1165 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  24.24 
 
 		 2578 aa  53.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  24.24 
 
 		 2906 aa  52.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  24.78 
 
 		 1762 aa  52.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  24.78 
 
 		 1762 aa  52.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  24.24 
 
 		 1861 aa  52.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  22.83 
 
 		 1113 aa  52  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  28.07 
 
 		 1571 aa  52  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  22.87 
 
 		 1004 aa  51.2  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 202 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  50 
 
 		 1281 aa  48.9  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  48.84 
 
 		 259 aa  48.5  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  22.34 
 
 		 820 aa  48.5  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.63 
 
 		 1197 aa  48.5  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  25.85 
 
 		 927 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  23.24 
 
 		 924 aa  48.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  42 
 
 		 261 aa  48.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  22.5 
 
 		 909 aa  47.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  28.4 
 
 		 236 aa  47.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  21.24 
 
 		 997 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  25.51 
 
 		 914 aa  45.8  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 		 203 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  23.16 
 
 		 1327 aa  45.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>