130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01481 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  948    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  100 
 
 
1327 aa  967    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  99.57 
 
 
1806 aa  965    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  93.03 
 
 
1626 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  55.7 
 
 
1594 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  54.6 
 
 
1579 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  52.8 
 
 
1327 aa  518  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  52.8 
 
 
1327 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  53 
 
 
1349 aa  520  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  53.76 
 
 
2637 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.92 
 
 
868 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  47.6 
 
 
4391 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  47.38 
 
 
4312 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  47.59 
 
 
773 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  43.14 
 
 
1165 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  43.14 
 
 
1165 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  50 
 
 
955 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  49.71 
 
 
955 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  37.42 
 
 
1102 aa  326  5e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  48.05 
 
 
338 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  46.89 
 
 
306 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  37.14 
 
 
989 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  36.19 
 
 
1004 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  35.64 
 
 
997 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.09 
 
 
806 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  33.48 
 
 
1234 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  33 
 
 
2057 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  33.68 
 
 
1277 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  30.23 
 
 
1234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.43 
 
 
1234 aa  196  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  30.43 
 
 
1250 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  30.23 
 
 
1254 aa  193  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  29.81 
 
 
1234 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  29.61 
 
 
1252 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  29.19 
 
 
1250 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  33.1 
 
 
1113 aa  162  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.11 
 
 
3322 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  32.57 
 
 
1108 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  33.49 
 
 
1861 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  28.94 
 
 
995 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  33.49 
 
 
2578 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  32.92 
 
 
2906 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30 
 
 
1086 aa  136  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  27.68 
 
 
1028 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  34.18 
 
 
950 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.3 
 
 
1023 aa  126  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  29.93 
 
 
1012 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  35.53 
 
 
861 aa  123  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  31.55 
 
 
3420 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  30.98 
 
 
3415 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  31.34 
 
 
2926 aa  120  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  28.39 
 
 
1040 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  30.1 
 
 
1259 aa  113  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  26.75 
 
 
1099 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  30.1 
 
 
1259 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.91 
 
 
825 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  30.02 
 
 
1285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  29.9 
 
 
1269 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.57 
 
 
818 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  32.71 
 
 
1593 aa  110  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  29.9 
 
 
1254 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  29.82 
 
 
1268 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  26.85 
 
 
819 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  28.15 
 
 
1067 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  28.51 
 
 
1571 aa  103  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  27.38 
 
 
947 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  27.6 
 
 
1093 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 
1068 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  27.6 
 
 
1093 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  27.73 
 
 
1070 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  27.55 
 
 
773 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  28.03 
 
 
1070 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  27.15 
 
 
733 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  27.78 
 
 
1763 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.45 
 
 
1115 aa  90.1  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  28.24 
 
 
1748 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  27.84 
 
 
1762 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  27.84 
 
 
1762 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  27.57 
 
 
1753 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 
1770 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  26.93 
 
 
820 aa  85.1  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  28.27 
 
 
1770 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  26.42 
 
 
731 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  24.11 
 
 
924 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.63 
 
 
870 aa  80.5  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  24.49 
 
 
732 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.24 
 
 
1357 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.64 
 
 
769 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0822  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.52 
 
 
854 aa  76.3  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  25.06 
 
 
709 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  23.58 
 
 
815 aa  74.3  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  25.23 
 
 
730 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  27.25 
 
 
864 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  53.52 
 
 
506 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  53.52 
 
 
506 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1220  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.43 
 
 
863 aa  71.2  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  23.8 
 
 
729 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  25.86 
 
 
1741 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0823  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.44 
 
 
855 aa  68.2  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  42.2 
 
 
914 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>