116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3419 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  46.14 
 
 		 909 aa  700    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1009 aa  1989    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  39.31 
 
 		 825 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  37.68 
 
 		 818 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  38.57 
 
 		 819 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  48.68 
 
 		 914 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  46.79 
 
 		 927 aa  337  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  39.24 
 
 		 1099 aa  319  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  35.3 
 
 		 1093 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  35.3 
 
 		 1093 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  35.31 
 
 		 1049 aa  281  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  38.97 
 
 		 1040 aa  219  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  35.35 
 
 		 864 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  33.62 
 
 		 924 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  29.5 
 
 		 1741 aa  154  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.7 
 
 		 1357 aa  143  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.5 
 
 		 1023 aa  140  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.87 
 
 		 3322 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  32.17 
 
 		 947 aa  128  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  26.11 
 
 		 1594 aa  126  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  29.64 
 
 		 358 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  29.64 
 
 		 389 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  27.45 
 
 		 2057 aa  118  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  32.22 
 
 		 358 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  31.03 
 
 		 358 aa  115  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  30.36 
 
 		 356 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  33.4 
 
 		 1762 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  33.4 
 
 		 1762 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  30.86 
 
 		 1770 aa  109  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  31.59 
 
 		 1763 aa  109  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  30.56 
 
 		 1770 aa  108  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  30.14 
 
 		 1012 aa  108  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  49.28 
 
 		 1748 aa  107  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  25.6 
 
 		 1579 aa  107  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  30.03 
 
 		 1753 aa  105  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  25.44 
 
 		 1327 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  27.39 
 
 		 1349 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  25.37 
 
 		 1806 aa  99  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  46.58 
 
 		 1234 aa  99  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.24 
 
 		 868 aa  93.6  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  25.76 
 
 		 466 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  46.48 
 
 		 1055 aa  89.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  41.76 
 
 		 3420 aa  87.4  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  41.76 
 
 		 3415 aa  87  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  33.46 
 
 		 2926 aa  83.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.51 
 
 		 1067 aa  83.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  34.76 
 
 		 773 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  21.52 
 
 		 1004 aa  82.4  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  40.13 
 
 		 1277 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  24.62 
 
 		 820 aa  80.9  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  45.67 
 
 		 2637 aa  80.9  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  38.69 
 
 		 1571 aa  80.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  42.28 
 
 		 1068 aa  79  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  45.37 
 
 		 4312 aa  79  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  41.43 
 
 		 1165 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  41.73 
 
 		 989 aa  78.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  41.43 
 
 		 1165 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  49.52 
 
 		 948 aa  78.2  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  49.52 
 
 		 948 aa  78.2  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  48.57 
 
 		 949 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.75 
 
 		 1039 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  48.57 
 
 		 948 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.4 
 
 		 1197 aa  77  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.22 
 
 		 1086 aa  76.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  44.44 
 
 		 4391 aa  76.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  25.76 
 
 		 1070 aa  75.5  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  24.92 
 
 		 1070 aa  75.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  24.7 
 
 		 1113 aa  75.5  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  37.79 
 
 		 1108 aa  74.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  34.27 
 
 		 950 aa  73.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  40.29 
 
 		 1593 aa  70.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  34.64 
 
 		 861 aa  70.1  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  41.46 
 
 		 1028 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  38.98 
 
 		 1102 aa  69.3  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.62 
 
 		 806 aa  69.3  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  34.83 
 
 		 1626 aa  68.2  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  30.85 
 
 		 955 aa  67  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  25.63 
 
 		 2578 aa  66.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  50.63 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  50.63 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  30.85 
 
 		 955 aa  65.1  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  26.35 
 
 		 997 aa  64.7  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  38.41 
 
 		 1259 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  26.26 
 
 		 1861 aa  63.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  36.16 
 
 		 1259 aa  63.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  36.52 
 
 		 1285 aa  63.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  40.46 
 
 		 1269 aa  62.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  25.46 
 
 		 2906 aa  62.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  39.69 
 
 		 1268 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  39.69 
 
 		 1254 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 1971 aa  58.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  27.54 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  36.31 
 
 		 2885 aa  55.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  23.02 
 
 		 955 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.02 
 
 		 955 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  23.02 
 
 		 955 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.01 
 
 		 2667 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  25.6 
 
 		 733 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  22.66 
 
 		 955 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  24.04 
 
 		 773 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>