22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1287 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1287  pertactin  100 
 
 		 454 aa  880    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  91.73 
 
 		 1441 aa  659    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  87.97 
 
 		 1541 aa  633  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  43.58 
 
 		 1117 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  43.65 
 
 		 562 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1571 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.55 
 
 		 1526 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  27.65 
 
 		 1526 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  26.2 
 
 		 638 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  26.2 
 
 		 638 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  26.2 
 
 		 638 aa  50.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  25.65 
 
 		 863 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  35.79 
 
 		 729 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  25.32 
 
 		 863 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1565 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  39.33 
 
 		 747 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  25.32 
 
 		 836 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.32 
 
 		 836 aa  47  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  25.32 
 
 		 836 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  26.92 
 
 		 948 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  41.79 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2139  antigen 43, truncation  26.92 
 
 		 583 aa  43.5  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>