66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1286 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 562 aa  1127    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  62.61 
 
 		 1541 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  97.13 
 
 		 1117 aa  1110    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  62.78 
 
 		 1441 aa  698    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  32.17 
 
 		 732 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  32.92 
 
 		 773 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  29.69 
 
 		 836 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  29.69 
 
 		 863 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  29.69 
 
 		 836 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.69 
 
 		 836 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  31.9 
 
 		 733 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  29.83 
 
 		 863 aa  211  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  31.84 
 
 		 731 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  29.72 
 
 		 863 aa  208  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  33.58 
 
 		 429 aa  206  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  30.95 
 
 		 709 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  32.42 
 
 		 769 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  32.8 
 
 		 747 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  31.82 
 
 		 729 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  32.67 
 
 		 730 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1571 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1565 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.48 
 
 		 1526 aa  191  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  28.48 
 
 		 1526 aa  190  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1287  pertactin  43.65 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  28.78 
 
 		 759 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  28.57 
 
 		 759 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  28.57 
 
 		 759 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  29.53 
 
 		 638 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  29.53 
 
 		 638 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  29.53 
 
 		 638 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  27.09 
 
 		 1008 aa  165  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  31.78 
 
 		 236 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  26.35 
 
 		 815 aa  122  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  27.82 
 
 		 765 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  27.6 
 
 		 800 aa  105  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  28.62 
 
 		 470 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  28.62 
 
 		 681 aa  93.6  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  28.62 
 
 		 680 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  28.62 
 
 		 714 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  28.62 
 
 		 868 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  28.3 
 
 		 1003 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  26.81 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  26.81 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  27.67 
 
 		 922 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  27.67 
 
 		 968 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  27.67 
 
 		 1000 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 		 968 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  24.05 
 
 		 955 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.05 
 
 		 955 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  24.05 
 
 		 955 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  24.05 
 
 		 955 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  23.74 
 
 		 961 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  34.02 
 
 		 108 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  34.02 
 
 		 108 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  24.51 
 
 		 955 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  24.51 
 
 		 955 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1165 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  23.9 
 
 		 1093 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  23.9 
 
 		 1093 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1165 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.61 
 
 		 1369 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  23.73 
 
 		 1115 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  23.91 
 
 		 1571 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  23.53 
 
 		 1099 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>