75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0751 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  99.07 
 
 		 836 aa  869    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  99.07 
 
 		 863 aa  870    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  99.07 
 
 		 863 aa  871    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  100 
 
 		 429 aa  871    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  98.37 
 
 		 863 aa  864    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  99.07 
 
 		 836 aa  869    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  99.07 
 
 		 836 aa  869    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  53.6 
 
 		 1526 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  53.6 
 
 		 1526 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  53.17 
 
 		 1565 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  51.16 
 
 		 1571 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  57.2 
 
 		 236 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  35.37 
 
 		 732 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  35.37 
 
 		 773 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  37.41 
 
 		 769 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  36.78 
 
 		 709 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  36.76 
 
 		 731 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  35.68 
 
 		 1008 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  36.27 
 
 		 729 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 730 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  34.31 
 
 		 733 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  36.32 
 
 		 638 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  36.32 
 
 		 638 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  36.08 
 
 		 638 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  35.54 
 
 		 747 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  33.41 
 
 		 759 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  33.18 
 
 		 759 aa  216  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  32.95 
 
 		 759 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  33.33 
 
 		 1117 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  33.58 
 
 		 562 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  33.83 
 
 		 1541 aa  199  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  33.33 
 
 		 1441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  28.14 
 
 		 815 aa  152  8.999999999999999e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  25.74 
 
 		 800 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  51.88 
 
 		 136 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  59.26 
 
 		 108 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  58.82 
 
 		 108 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  26.79 
 
 		 765 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  27.59 
 
 		 714 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  27.83 
 
 		 680 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  28.08 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  27.32 
 
 		 1003 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  27.95 
 
 		 681 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  27.95 
 
 		 868 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 		 968 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  26.91 
 
 		 922 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  26.91 
 
 		 968 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  27.51 
 
 		 1000 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  27.65 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  26.72 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01158  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.207051  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01148  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.231444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1273  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284245  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  25.31 
 
 		 955 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  25.31 
 
 		 955 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.31 
 
 		 955 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  25.31 
 
 		 955 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  24.94 
 
 		 961 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  26 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 1602 aa  56.2  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  25.56 
 
 		 1327 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  25.56 
 
 		 1806 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  23.19 
 
 		 1067 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  22.58 
 
 		 1108 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4650  serine protease EatA  23.81 
 
 		 1285 aa  47  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  34.23 
 
 		 1070 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  34.23 
 
 		 1070 aa  46.6  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.23 
 
 		 1134 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  29.51 
 
 		 1154 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  21.99 
 
 		 1300 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1287  pertactin  41.79 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  23.44 
 
 		 1594 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.78 
 
 		 1369 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  28 
 
 		 2637 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  22.36 
 
 		 773 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>