45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4650 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4650  serine protease EatA  100 
 
 		 1285 aa  2620    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  55.56 
 
 		 1300 aa  1411    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  43.64 
 
 		 1366 aa  635  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3921  outer membrane autotransporter  32.73 
 
 		 1269 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728778 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1975  anti-codon nuclease masking agent  30.58 
 
 		 1225 aa  234  7.000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.528264  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0154  peptidase S6 IgA endopeptidase  23.35 
 
 		 1252 aa  89.4  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1327  serine proteAse eata  92.68 
 
 		 41 aa  81.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  24.93 
 
 		 709 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1064  peptidase S6 IgA endopeptidase  23.67 
 
 		 1284 aa  73.2  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  24.93 
 
 		 769 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  29.82 
 
 		 815 aa  67.8  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  27.69 
 
 		 729 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1065  peptidase S6 IgA endopeptidase  25.7 
 
 		 1287 aa  65.5  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  28.99 
 
 		 730 aa  62.4  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  23.7 
 
 		 961 aa  62  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  23.38 
 
 		 955 aa  62  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  23.38 
 
 		 955 aa  61.6  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  27.12 
 
 		 638 aa  62  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.38 
 
 		 955 aa  62  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  26.55 
 
 		 638 aa  61.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  26.55 
 
 		 638 aa  61.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  26.37 
 
 		 773 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  25.26 
 
 		 731 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  23.05 
 
 		 955 aa  60.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  25.76 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0244  hypothetical protein  31.03 
 
 		 192 aa  58.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0186  peptidase S6 IgA endopeptidase  23.03 
 
 		 2192 aa  55.1  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  28.65 
 
 		 759 aa  55.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  28.11 
 
 		 759 aa  53.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  28.11 
 
 		 759 aa  53.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  27.8 
 
 		 747 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  31.17 
 
 		 1593 aa  52.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  23.26 
 
 		 836 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  23.26 
 
 		 836 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  24.19 
 
 		 733 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.26 
 
 		 836 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  23.26 
 
 		 863 aa  50.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  23.26 
 
 		 863 aa  50.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2717  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.92 
 
 		 877 aa  50.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.09 
 
 		 1086 aa  48.5  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  25.13 
 
 		 800 aa  47.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  29.14 
 
 		 820 aa  47.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  23.81 
 
 		 429 aa  47  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  23.86 
 
 		 1008 aa  47.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  25.37 
 
 		 714 aa  46.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>