18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2717 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2717  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
877 aa  1764    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1519  outer membrane autotransporter barrel domain protein  49.12 
 
 
1464 aa  589  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.796845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3278  outer membrane autotransporter barrel domain protein  50.24 
 
 
840 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3954  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.46 
 
 
1348 aa  491  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1739  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.7 
 
 
2596 aa  55.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  25.64 
 
 
1300 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  26.05 
 
 
759 aa  50.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4650  serine protease EatA  26.92 
 
 
1285 aa  50.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  26.47 
 
 
759 aa  49.3  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  21.48 
 
 
763 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  27.65 
 
 
759 aa  49.3  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.4 
 
 
1048 aa  47.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  24.55 
 
 
626 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.78 
 
 
2437 aa  47  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  23.64 
 
 
629 aa  47  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3724  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.38 
 
 
2370 aa  45.8  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  23.18 
 
 
629 aa  45.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4100  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.3 
 
 
2225 aa  44.3  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>