96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0449 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  90.69 
 
 		 629 aa  1139    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  59.81 
 
 		 636 aa  725    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  61.08 
 
 		 646 aa  747    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  59.69 
 
 		 646 aa  753    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  58.08 
 
 		 640 aa  722    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  90.22 
 
 		 629 aa  1135    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  86.12 
 
 		 629 aa  1085    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 626 aa  1267    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  58.56 
 
 		 640 aa  736    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  28.27 
 
 		 630 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.77 
 
 		 617 aa  147  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  26.52 
 
 		 628 aa  137  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  27.52 
 
 		 594 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  24.92 
 
 		 628 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  25.76 
 
 		 597 aa  128  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  25.04 
 
 		 597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  28.36 
 
 		 662 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  27.11 
 
 		 656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  27.11 
 
 		 656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  26.87 
 
 		 656 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  26.88 
 
 		 584 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  30.15 
 
 		 337 aa  92.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  24.21 
 
 		 684 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  26.47 
 
 		 647 aa  87.8  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  28.8 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  24.35 
 
 		 664 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  30.54 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  30.54 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  29.33 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  29.23 
 
 		 319 aa  80.1  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  23.33 
 
 		 684 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.06 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.47 
 
 		 629 aa  77  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.93 
 
 		 641 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  23.93 
 
 		 723 aa  67.4  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  29.6 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  26.99 
 
 		 284 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  29.71 
 
 		 353 aa  67  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  25.24 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.48 
 
 		 774 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  25.48 
 
 		 658 aa  64.7  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  25.24 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  29.91 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.62 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  27.86 
 
 		 759 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  28.4 
 
 		 636 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  24.8 
 
 		 1025 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  29.41 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  23.45 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  22.57 
 
 		 607 aa  57  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  26.67 
 
 		 316 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  27.16 
 
 		 763 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.12 
 
 		 1842 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.12 
 
 		 1865 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.12 
 
 		 2302 aa  55.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.12 
 
 		 1953 aa  55.1  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.12 
 
 		 3015 aa  55.1  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  28.14 
 
 		 3954 aa  54.7  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.72 
 
 		 3152 aa  53.9  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  28.35 
 
 		 347 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  23.13 
 
 		 317 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  25.2 
 
 		 939 aa  52.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  22.96 
 
 		 816 aa  52  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  27.19 
 
 		 4238 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  28.76 
 
 		 1222 aa  51.6  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  24.29 
 
 		 341 aa  51.6  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  26.84 
 
 		 4238 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  21.51 
 
 		 1068 aa  50.4  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  27.19 
 
 		 3822 aa  50.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  25.66 
 
 		 1012 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  27.73 
 
 		 347 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  28.69 
 
 		 637 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.23 
 
 		 913 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  27.43 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  27.43 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  28.89 
 
 		 372 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  28.09 
 
 		 3506 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  27.43 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  22.76 
 
 		 728 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  22.76 
 
 		 728 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  22.76 
 
 		 728 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  27.09 
 
 		 379 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  27.09 
 
 		 379 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  27.09 
 
 		 379 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  27.09 
 
 		 379 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  25.48 
 
 		 454 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  27.68 
 
 		 379 aa  47.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  27.27 
 
 		 310 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  24.6 
 
 		 1369 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  30.86 
 
 		 985 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  22.83 
 
 		 972 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2717  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.55 
 
 		 877 aa  46.2  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  24.47 
 
 		 315 aa  45.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  26.32 
 
 		 1011 aa  44.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.44 
 
 		 915 aa  43.9  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  24.21 
 
 		 339 aa  43.9  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>