36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3921 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3921  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1269 aa  2569    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728778 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  34.23 
 
 		 1300 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4650  serine protease EatA  32.7 
 
 		 1285 aa  595  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  41.03 
 
 		 1366 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0154  peptidase S6 IgA endopeptidase  23.72 
 
 		 1252 aa  119  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1975  anti-codon nuclease masking agent  26.14 
 
 		 1225 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.528264  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0186  peptidase S6 IgA endopeptidase  24.17 
 
 		 2192 aa  106  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1064  peptidase S6 IgA endopeptidase  22.66 
 
 		 1284 aa  103  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1065  peptidase S6 IgA endopeptidase  23.91 
 
 		 1287 aa  102  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 		 729 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  23.69 
 
 		 638 aa  65.1  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.16 
 
 		 955 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  23.34 
 
 		 638 aa  63.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  27.16 
 
 		 955 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  23.34 
 
 		 638 aa  63.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  27.16 
 
 		 955 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0244  hypothetical protein  33.1 
 
 		 192 aa  62.4  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  26.72 
 
 		 955 aa  62.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  26.32 
 
 		 769 aa  62  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  27.14 
 
 		 961 aa  61.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  26.89 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1327  serine proteAse eata  65 
 
 		 41 aa  57.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  25 
 
 		 709 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  25.41 
 
 		 773 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  23.47 
 
 		 765 aa  55.5  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  27.5 
 
 		 731 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  27 
 
 		 747 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  28.57 
 
 		 820 aa  50.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  29.85 
 
 		 1593 aa  50.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.09 
 
 		 926 aa  48.9  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  24.39 
 
 		 815 aa  47.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  24.89 
 
 		 730 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  26.46 
 
 		 1748 aa  46.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  25.47 
 
 		 1008 aa  46.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0248  pathogenicity protein, putative, truncation  46.51 
 
 		 43 aa  46.2  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  22.61 
 
 		 759 aa  45.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>