79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1658 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  97.46 
 
 		 1571 aa  484  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  96.61 
 
 		 1565 aa  480  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  96.61 
 
 		 1526 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  96.61 
 
 		 1526 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  58.05 
 
 		 863 aa  289  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  56.78 
 
 		 836 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  56.78 
 
 		 863 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  57.2 
 
 		 429 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  56.78 
 
 		 836 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  56.78 
 
 		 836 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  56.78 
 
 		 863 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  95.61 
 
 		 136 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  96.3 
 
 		 108 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  94.44 
 
 		 108 aa  208  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  38.66 
 
 		 732 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  40.08 
 
 		 731 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  36.55 
 
 		 709 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  37.55 
 
 		 773 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  38.08 
 
 		 729 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  34.89 
 
 		 759 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  36.13 
 
 		 769 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  34.89 
 
 		 759 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  34.47 
 
 		 759 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  34.6 
 
 		 1008 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  35.56 
 
 		 730 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  37.56 
 
 		 733 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01148  hypothetical protein  91.43 
 
 		 70 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.231444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01158  hypothetical protein  91.43 
 
 		 70 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.207051  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1273  hypothetical protein  91.43 
 
 		 70 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284245  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  31.78 
 
 		 1117 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  32.77 
 
 		 800 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  34.32 
 
 		 1541 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  34.75 
 
 		 1441 aa  125  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  31.78 
 
 		 562 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  33.33 
 
 		 638 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 638 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  35.59 
 
 		 747 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  32.91 
 
 		 638 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  28.27 
 
 		 815 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  28.36 
 
 		 765 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01157  hypothetical protein  94.87 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  26.05 
 
 		 714 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  25.94 
 
 		 681 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  25.94 
 
 		 680 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  25.94 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  25.94 
 
 		 868 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  25.52 
 
 		 1003 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  26.47 
 
 		 465 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  26.47 
 
 		 922 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 		 968 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  26.47 
 
 		 968 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  26.47 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  26.47 
 
 		 1000 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  26.84 
 
 		 1369 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  27.22 
 
 		 955 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  27.22 
 
 		 955 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.22 
 
 		 955 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  27.22 
 
 		 955 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.32 
 
 		 947 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  33.66 
 
 		 1593 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  35.64 
 
 		 1113 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  31.86 
 
 		 1108 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  28.4 
 
 		 961 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  30.97 
 
 		 950 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  28.66 
 
 		 358 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  31.03 
 
 		 1012 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  32.11 
 
 		 1004 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  32.11 
 
 		 997 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  29.11 
 
 		 358 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  25.74 
 
 		 466 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.46 
 
 		 1055 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  26.67 
 
 		 1861 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 		 358 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  28.86 
 
 		 389 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  25.74 
 
 		 1327 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  35.37 
 
 		 3420 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  35.37 
 
 		 3415 aa  42  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  25.74 
 
 		 1806 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>