219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3373 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  100 
 
 
3635 aa  6717    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  70.74 
 
 
4726 aa  1019    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  42.08 
 
 
2868 aa  979    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  66.05 
 
 
4384 aa  2654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  34.73 
 
 
1309 aa  531  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  33.53 
 
 
2832 aa  480  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  45.9 
 
 
990 aa  364  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  47.32 
 
 
735 aa  333  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  30.47 
 
 
4191 aa  321  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  34.16 
 
 
2396 aa  286  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  35.31 
 
 
1326 aa  275  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  40.83 
 
 
1090 aa  260  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  40.83 
 
 
1090 aa  260  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  40.83 
 
 
1090 aa  260  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  46.61 
 
 
877 aa  259  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  40.83 
 
 
1122 aa  259  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  40.65 
 
 
1074 aa  258  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  37.21 
 
 
3192 aa  258  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  40.65 
 
 
1122 aa  258  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  40.65 
 
 
1122 aa  257  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  46.84 
 
 
810 aa  247  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  37.52 
 
 
880 aa  245  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  30.26 
 
 
1447 aa  244  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  30.22 
 
 
1447 aa  243  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  34.46 
 
 
3718 aa  241  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  29.17 
 
 
1472 aa  241  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  29.9 
 
 
1446 aa  240  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  37.02 
 
 
876 aa  240  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  35.84 
 
 
878 aa  234  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  32.13 
 
 
1451 aa  234  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  30.34 
 
 
1342 aa  233  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  36.89 
 
 
1246 aa  232  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  31.66 
 
 
1204 aa  231  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  38.5 
 
 
963 aa  231  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  32.82 
 
 
1125 aa  229  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  31.44 
 
 
1197 aa  222  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  31.35 
 
 
1197 aa  220  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  31.35 
 
 
1197 aa  220  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  42.2 
 
 
472 aa  200  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  33.18 
 
 
3126 aa  199  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  55.87 
 
 
373 aa  193  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  55.87 
 
 
373 aa  193  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  55.87 
 
 
378 aa  192  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  56.5 
 
 
192 aa  192  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  56.5 
 
 
192 aa  192  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  36.8 
 
 
1674 aa  191  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  35.44 
 
 
2141 aa  190  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  34.96 
 
 
1549 aa  189  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  54.24 
 
 
533 aa  186  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  36.01 
 
 
597 aa  186  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  37.6 
 
 
1613 aa  186  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  28.84 
 
 
1440 aa  182  8e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  51.41 
 
 
378 aa  181  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  51.41 
 
 
460 aa  180  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  51.46 
 
 
962 aa  180  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  51.46 
 
 
1186 aa  180  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  51.46 
 
 
1068 aa  179  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  51.94 
 
 
1012 aa  179  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  35.19 
 
 
597 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  35.19 
 
 
597 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  35.07 
 
 
1616 aa  177  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  35.07 
 
 
1616 aa  177  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  32.99 
 
 
1588 aa  176  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  32.99 
 
 
1616 aa  176  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  53.07 
 
 
1654 aa  173  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  50.84 
 
 
1535 aa  169  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  50.84 
 
 
1626 aa  169  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  50.84 
 
 
1766 aa  169  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  50.84 
 
 
1705 aa  169  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  50.84 
 
 
1669 aa  169  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  54.24 
 
 
617 aa  168  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  51.4 
 
 
715 aa  168  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  53.67 
 
 
827 aa  167  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  34.82 
 
 
1117 aa  167  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  48.86 
 
 
525 aa  166  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  54.07 
 
 
737 aa  164  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  54.49 
 
 
135 aa  157  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  54.49 
 
 
135 aa  157  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  53.37 
 
 
3355 aa  153  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  31.33 
 
 
2157 aa  151  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  29.29 
 
 
1516 aa  151  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  49.2 
 
 
650 aa  148  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  30.87 
 
 
1434 aa  148  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  36.24 
 
 
716 aa  145  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  34.85 
 
 
716 aa  144  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  30.61 
 
 
1854 aa  144  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  36.12 
 
 
831 aa  144  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  30.5 
 
 
1546 aa  144  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  30.5 
 
 
1471 aa  144  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  30.5 
 
 
1471 aa  144  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  29.36 
 
 
1190 aa  143  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  36.12 
 
 
831 aa  143  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  36.12 
 
 
831 aa  143  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  36.12 
 
 
820 aa  143  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  36.12 
 
 
816 aa  143  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  36.12 
 
 
816 aa  143  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  36.12 
 
 
816 aa  143  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  36.12 
 
 
816 aa  143  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  30.05 
 
 
1353 aa  142  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  37.43 
 
 
536 aa  142  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>