203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2583 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  100 
 
 
990 aa  1876    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  50.35 
 
 
4384 aa  703    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  49.42 
 
 
1613 aa  625  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  42.1 
 
 
2868 aa  502  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  44.59 
 
 
4726 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  36.8 
 
 
963 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  38.1 
 
 
3718 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  44.48 
 
 
3635 aa  344  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  34.86 
 
 
1246 aa  342  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  34.93 
 
 
1309 aa  217  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  33.07 
 
 
1125 aa  209  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  35.22 
 
 
1197 aa  208  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  35.22 
 
 
1197 aa  208  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  34.88 
 
 
1197 aa  207  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  34.54 
 
 
1204 aa  204  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  31.87 
 
 
753 aa  195  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  28.75 
 
 
1326 aa  189  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  30.83 
 
 
2832 aa  189  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  30.91 
 
 
967 aa  187  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  29.68 
 
 
1342 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  34.45 
 
 
3126 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  31.02 
 
 
3192 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  31.35 
 
 
1122 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  31.21 
 
 
1090 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  31.21 
 
 
1122 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  31.21 
 
 
1090 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  31.21 
 
 
1090 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  31.21 
 
 
1074 aa  182  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  31.21 
 
 
1122 aa  182  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  55.68 
 
 
735 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  30.43 
 
 
4191 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  31.35 
 
 
1446 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  35.6 
 
 
597 aa  174  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  35.6 
 
 
597 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  35.6 
 
 
597 aa  174  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  31.52 
 
 
1447 aa  173  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  31.57 
 
 
1447 aa  167  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  32.4 
 
 
2157 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  29.77 
 
 
1472 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  25.66 
 
 
1235 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  38.49 
 
 
575 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  28.69 
 
 
1549 aa  129  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  33.24 
 
 
1616 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  33.24 
 
 
1616 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  35.15 
 
 
977 aa  124  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  33.53 
 
 
1674 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  51.53 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  34.63 
 
 
880 aa  122  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  42.53 
 
 
1451 aa  122  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  32.92 
 
 
1588 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  33.85 
 
 
1616 aa  122  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  39.44 
 
 
1440 aa  121  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  34.77 
 
 
589 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  42.7 
 
 
831 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  38.87 
 
 
655 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  37.71 
 
 
356 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  42.13 
 
 
816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  42.13 
 
 
816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  42.13 
 
 
816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  42.13 
 
 
820 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  42.13 
 
 
816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  42.13 
 
 
831 aa  119  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  42.13 
 
 
831 aa  119  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  36.99 
 
 
716 aa  118  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  45.86 
 
 
876 aa  117  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  35.88 
 
 
279 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  35.6 
 
 
423 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  36.99 
 
 
716 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  45.64 
 
 
533 aa  115  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  41.94 
 
 
373 aa  115  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  41.94 
 
 
373 aa  115  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  37.65 
 
 
878 aa  115  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  41.94 
 
 
378 aa  115  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  41.94 
 
 
192 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  41.94 
 
 
192 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  30.98 
 
 
1713 aa  114  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  36.59 
 
 
536 aa  114  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  33.78 
 
 
1916 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  33.23 
 
 
877 aa  112  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  43.82 
 
 
810 aa  111  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  38.93 
 
 
2866 aa  107  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  40.91 
 
 
2504 aa  107  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  40.34 
 
 
1390 aa  106  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  42.58 
 
 
525 aa  106  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  34.69 
 
 
2095 aa  105  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  42.26 
 
 
378 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  42.26 
 
 
460 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  33.64 
 
 
898 aa  103  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  44.97 
 
 
1012 aa  99.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  34.69 
 
 
330 aa  100  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  38.91 
 
 
2141 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  44.97 
 
 
1068 aa  99.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  44.97 
 
 
1186 aa  99  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  44.3 
 
 
962 aa  98.6  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  42.53 
 
 
473 aa  97.8  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  29.07 
 
 
1814 aa  97.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  41.5 
 
 
1654 aa  95.5  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  39.46 
 
 
1766 aa  91.3  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  39.46 
 
 
715 aa  91.3  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  39.46 
 
 
1705 aa  91.3  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>