213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3939 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  66.3 
 
 		 1616 aa  1838    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  66.17 
 
 		 1588 aa  1798    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  61.24 
 
 		 1342 aa  1196    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  100 
 
 		 1549 aa  2987    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  58.17 
 
 		 1446 aa  1367    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  54.63 
 
 		 1472 aa  1407    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  66.3 
 
 		 1616 aa  1838    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  65.16 
 
 		 1616 aa  1794    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  58.46 
 
 		 1447 aa  1373    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  58.69 
 
 		 1447 aa  1382    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  71.49 
 
 		 753 aa  944    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  64.01 
 
 		 1674 aa  1837    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  98.51 
 
 		 279 aa  522  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  35.85 
 
 		 1117 aa  301  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  47.53 
 
 		 1713 aa  273  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  31.29 
 
 		 1309 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  28.78 
 
 		 1326 aa  249  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  35.52 
 
 		 716 aa  243  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  34.81 
 
 		 716 aa  234  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  32.14 
 
 		 2396 aa  209  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  32.75 
 
 		 877 aa  203  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  33.33 
 
 		 1854 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  38.43 
 
 		 1434 aa  202  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  37.69 
 
 		 1353 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  32.87 
 
 		 1546 aa  190  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  36.13 
 
 		 4726 aa  189  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  33.44 
 
 		 880 aa  184  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  35.71 
 
 		 831 aa  181  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  32.87 
 
 		 876 aa  181  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  35.29 
 
 		 831 aa  179  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  35.29 
 
 		 831 aa  179  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  35.29 
 
 		 816 aa  179  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  35.29 
 
 		 816 aa  179  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  35.29 
 
 		 816 aa  179  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  35.29 
 
 		 816 aa  179  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  35.29 
 
 		 820 aa  179  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  30.22 
 
 		 2157 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  34.5 
 
 		 2141 aa  174  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  31.85 
 
 		 878 aa  173  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  37.2 
 
 		 1471 aa  171  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  37.2 
 
 		 1471 aa  171  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  30.12 
 
 		 1072 aa  164  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  33.98 
 
 		 3635 aa  162  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  32.02 
 
 		 472 aa  161  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  30.57 
 
 		 1613 aa  161  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  29.05 
 
 		 1090 aa  155  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  29.05 
 
 		 1090 aa  155  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  29.05 
 
 		 1090 aa  155  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  28.36 
 
 		 1197 aa  153  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  28.36 
 
 		 1197 aa  153  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  27.1 
 
 		 4191 aa  153  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  28.36 
 
 		 1197 aa  152  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  30.33 
 
 		 1390 aa  151  9e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  30.2 
 
 		 2504 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  28.85 
 
 		 1204 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  28.85 
 
 		 3718 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  30.02 
 
 		 1440 aa  150  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  28.98 
 
 		 1125 aa  148  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  35.94 
 
 		 2868 aa  147  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  29.82 
 
 		 1190 aa  147  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  31.51 
 
 		 1230 aa  144  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  34.95 
 
 		 4384 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  36.96 
 
 		 330 aa  139  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  48.51 
 
 		 1487 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  33.03 
 
 		 536 aa  133  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  31.27 
 
 		 1417 aa  133  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  33.33 
 
 		 691 aa  131  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  34.48 
 
 		 810 aa  128  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  29.4 
 
 		 3126 aa  127  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  29.2 
 
 		 963 aa  126  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  28.82 
 
 		 990 aa  125  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  32.35 
 
 		 735 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  33.98 
 
 		 600 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  25.74 
 
 		 1235 aa  119  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  29.79 
 
 		 575 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  29.53 
 
 		 1411 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  28.28 
 
 		 967 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  33.93 
 
 		 1814 aa  115  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  44.28 
 
 		 548 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  31.33 
 
 		 3355 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  30.45 
 
 		 597 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  32.71 
 
 		 2832 aa  112  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  31.81 
 
 		 597 aa  111  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  31.81 
 
 		 597 aa  111  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  31.52 
 
 		 1451 aa  110  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2308  Haemagluttinin domain protein  31.98 
 
 		 744 aa  109  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2684  hemagluttinin family protein  31.98 
 
 		 706 aa  108  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  28.88 
 
 		 1122 aa  108  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  28.88 
 
 		 1074 aa  107  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  28.88 
 
 		 1122 aa  107  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  32.69 
 
 		 1065 aa  105  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  28.72 
 
 		 1122 aa  105  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  28.5 
 
 		 740 aa  103  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  43.38 
 
 		 2095 aa  103  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  34.61 
 
 		 3192 aa  102  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  30.42 
 
 		 423 aa  102  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  33.05 
 
 		 492 aa  101  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  28.53 
 
 		 766 aa  101  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  31.75 
 
 		 1259 aa  100  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  40.07 
 
 		 1012 aa  99.8  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>