183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2308 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2684  hemagluttinin family protein  99.86 
 
 		 706 aa  1281    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2308  Haemagluttinin domain protein  100 
 
 		 744 aa  1405    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3593  YadA domain protein  42.49 
 
 		 742 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50488  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  32.64 
 
 		 1472 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  42.78 
 
 		 1072 aa  97.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  28.02 
 
 		 3126 aa  94.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  42.46 
 
 		 597 aa  91.3  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  42.46 
 
 		 597 aa  91.3  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  41.9 
 
 		 597 aa  90.9  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  55.79 
 
 		 2866 aa  90.9  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  39.81 
 
 		 536 aa  88.6  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  34.69 
 
 		 715 aa  88.2  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  34.69 
 
 		 1766 aa  88.2  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  34.69 
 
 		 1626 aa  88.2  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  41.2 
 
 		 1705 aa  87.8  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  34.69 
 
 		 1669 aa  87.4  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  27.66 
 
 		 1342 aa  87.4  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  46.43 
 
 		 967 aa  87.4  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  34.69 
 
 		 1535 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  42.33 
 
 		 3355 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  31.78 
 
 		 1265 aa  86.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  32.93 
 
 		 1654 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  49.57 
 
 		 2392 aa  83.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  39.57 
 
 		 3718 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  35.16 
 
 		 4191 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  39.15 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  35.61 
 
 		 1326 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  29.03 
 
 		 1197 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  29.03 
 
 		 1197 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  40.69 
 
 		 589 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  40.18 
 
 		 827 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  29.03 
 
 		 1197 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  28.55 
 
 		 1447 aa  80.1  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  28.5 
 
 		 1309 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  28.5 
 
 		 1446 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  33.82 
 
 		 1549 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  27.93 
 
 		 1447 aa  77.8  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  34.51 
 
 		 1417 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  43.51 
 
 		 1616 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  43.51 
 
 		 1616 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  43.51 
 
 		 1616 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  48.7 
 
 		 601 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  43.51 
 
 		 1588 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  47.01 
 
 		 1674 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  41.03 
 
 		 810 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  40.1 
 
 		 617 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  42.66 
 
 		 877 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  34 
 
 		 4384 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  63.64 
 
 		 2868 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  40.24 
 
 		 2832 aa  72  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  36.36 
 
 		 737 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  40.33 
 
 		 3635 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  29.26 
 
 		 1451 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  37.5 
 
 		 1516 aa  70.5  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  45.53 
 
 		 989 aa  68.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  28.62 
 
 		 1204 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  48.41 
 
 		 1613 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  35.24 
 
 		 373 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  36.91 
 
 		 650 aa  67  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  35.68 
 
 		 378 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  36.43 
 
 		 548 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  39.82 
 
 		 4726 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  35.24 
 
 		 378 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  35.24 
 
 		 373 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  42.86 
 
 		 2396 aa  66.6  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  36.77 
 
 		 1012 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  39.45 
 
 		 5143 aa  65.5  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  39.2 
 
 		 1117 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  35.29 
 
 		 1405 aa  65.9  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  35.18 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  46.15 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  28.62 
 
 		 1125 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  49 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  35.6 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  35.6 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  50 
 
 		 1074 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  36.18 
 
 		 716 aa  64.3  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  50 
 
 		 1122 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  50 
 
 		 1122 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  50 
 
 		 1122 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  50 
 
 		 1090 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  50 
 
 		 1090 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  50 
 
 		 1090 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1951  membrane-anchored cell surface protein  68.52 
 
 		 1608 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  68.52 
 
 		 459 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0463  putative membrane-anchored cell surface protein  68.52 
 
 		 1616 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.590511  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  48.31 
 
 		 533 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  42.61 
 
 		 655 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  58.33 
 
 		 2493 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  32.35 
 
 		 2504 aa  63.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  68.52 
 
 		 459 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  68.52 
 
 		 322 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  36.73 
 
 		 1186 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  32.85 
 
 		 1440 aa  63.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  68.52 
 
 		 459 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  36.71 
 
 		 1246 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  32.85 
 
 		 1190 aa  63.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  26.9 
 
 		 799 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0533  YadA-like C-terminal region protein  68.52 
 
 		 229 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  35.68 
 
 		 716 aa  62.4  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>