206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0142 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1040    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  43.95 
 
 		 962 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  43.93 
 
 		 1012 aa  257  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  44.73 
 
 		 1186 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  41.01 
 
 		 1068 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  39.96 
 
 		 827 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  39.25 
 
 		 617 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  38.7 
 
 		 737 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  37.44 
 
 		 877 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  35.79 
 
 		 536 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  37.53 
 
 		 601 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  37.08 
 
 		 2868 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  36.6 
 
 		 810 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  32.35 
 
 		 575 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  30.7 
 
 		 1654 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  32.8 
 
 		 650 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  35.32 
 
 		 589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  35.14 
 
 		 655 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  43.75 
 
 		 4191 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  36.73 
 
 		 735 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  32.17 
 
 		 2505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  35.46 
 
 		 3635 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  33.08 
 
 		 1326 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  37.24 
 
 		 2392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  41.82 
 
 		 1588 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  40.29 
 
 		 1674 aa  120  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  34.34 
 
 		 2504 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  36.1 
 
 		 1265 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  35.58 
 
 		 831 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  34.34 
 
 		 1390 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  40.3 
 
 		 378 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  30.37 
 
 		 2866 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  30.22 
 
 		 1669 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  33.03 
 
 		 2095 aa  115  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  38.91 
 
 		 3355 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  35.68 
 
 		 831 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  35.68 
 
 		 831 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  30.14 
 
 		 715 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  30.22 
 
 		 1535 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  35.68 
 
 		 816 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  35.68 
 
 		 820 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  35.68 
 
 		 816 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  35.68 
 
 		 816 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  40.3 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  35.68 
 
 		 816 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  30.22 
 
 		 1766 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  31.34 
 
 		 1616 aa  114  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  30.22 
 
 		 1705 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  31.34 
 
 		 1616 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1616 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  44.28 
 
 		 1549 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  30.22 
 
 		 1626 aa  113  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  29.75 
 
 		 4384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  32.28 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  39.15 
 
 		 1613 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  29.9 
 
 		 2728 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  29.9 
 
 		 2778 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  29.9 
 
 		 1411 aa  107  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0855  outer membrane protein XadA  36.11 
 
 		 815 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.912116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  31.43 
 
 		 492 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  37 
 
 		 2832 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  35.95 
 
 		 997 aa  106  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  34.17 
 
 		 1190 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  34.35 
 
 		 3718 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  34.17 
 
 		 1440 aa  105  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  27.62 
 
 		 597 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  36.86 
 
 		 3192 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  29.29 
 
 		 2814 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  36.81 
 
 		 3126 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  32.83 
 
 		 989 aa  103  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  38.78 
 
 		 1309 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  31.44 
 
 		 716 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  34.45 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  29.4 
 
 		 1854 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  34.45 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  34.45 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  40.41 
 
 		 192 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  40.41 
 
 		 192 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  30.77 
 
 		 1122 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  30.77 
 
 		 1090 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  30.77 
 
 		 1090 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  30.77 
 
 		 1090 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  30.77 
 
 		 1122 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  30.77 
 
 		 1122 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  31.05 
 
 		 1074 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  38.97 
 
 		 533 aa  99.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  32.29 
 
 		 418 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  28.42 
 
 		 1472 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  27.27 
 
 		 597 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  29.25 
 
 		 1117 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  27.27 
 
 		 597 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  27.99 
 
 		 1446 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2286  YadA domain-containing protein  38.18 
 
 		 1584 aa  98.2  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0535407  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  29.85 
 
 		 1546 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  29.63 
 
 		 1471 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  29.63 
 
 		 1471 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  25.69 
 
 		 1342 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  25.69 
 
 		 1447 aa  96.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  37.5 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  42.03 
 
 		 1246 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>