201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3152 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  44.9 
 
 		 3355 aa  1312    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  35.81 
 
 		 3718 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  100 
 
 		 4191 aa  8018    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  35.16 
 
 		 3192 aa  525  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  33.66 
 
 		 2832 aa  504  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  47.12 
 
 		 1072 aa  418  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  32.33 
 
 		 1246 aa  303  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  33.04 
 
 		 3126 aa  298  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  33.31 
 
 		 1613 aa  259  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  34.36 
 
 		 4384 aa  259  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  30.8 
 
 		 1451 aa  242  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  36.62 
 
 		 1074 aa  239  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  29.24 
 
 		 1326 aa  239  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  36.62 
 
 		 1090 aa  239  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  36.49 
 
 		 1122 aa  239  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  36.62 
 
 		 1090 aa  239  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  36.62 
 
 		 1090 aa  239  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  36.88 
 
 		 1122 aa  238  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  36.88 
 
 		 1122 aa  238  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  33.6 
 
 		 963 aa  231  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  30.76 
 
 		 1197 aa  208  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  30.76 
 
 		 1197 aa  208  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  30.61 
 
 		 1197 aa  205  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  31.69 
 
 		 1125 aa  200  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  31.43 
 
 		 1204 aa  199  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  56.08 
 
 		 1186 aa  188  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  56.02 
 
 		 962 aa  187  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  56.02 
 
 		 1012 aa  186  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  33.16 
 
 		 967 aa  182  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  28.65 
 
 		 1549 aa  174  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  30.57 
 
 		 2868 aa  173  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  32.34 
 
 		 2157 aa  172  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  30.32 
 
 		 1447 aa  171  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  38.31 
 
 		 1309 aa  166  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  50.87 
 
 		 378 aa  164  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  50.87 
 
 		 460 aa  163  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  51.58 
 
 		 533 aa  162  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  50.57 
 
 		 1654 aa  161  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  42.98 
 
 		 1626 aa  161  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  37.28 
 
 		 3635 aa  161  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  39.88 
 
 		 597 aa  161  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  35.42 
 
 		 1705 aa  160  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  42.98 
 
 		 1766 aa  160  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  43.4 
 
 		 715 aa  160  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  42.98 
 
 		 1669 aa  160  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  55.13 
 
 		 378 aa  159  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  55.13 
 
 		 373 aa  159  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  55.13 
 
 		 373 aa  159  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  42.98 
 
 		 1535 aa  159  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  38.87 
 
 		 597 aa  159  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  38.87 
 
 		 597 aa  159  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  55.13 
 
 		 192 aa  159  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  55.13 
 
 		 192 aa  159  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  40.75 
 
 		 2392 aa  158  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  50 
 
 		 827 aa  151  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  50.9 
 
 		 617 aa  150  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  29.02 
 
 		 1616 aa  149  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1616 aa  149  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  54.36 
 
 		 2141 aa  149  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  54.61 
 
 		 737 aa  147  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  42.21 
 
 		 735 aa  147  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  28.94 
 
 		 1616 aa  146  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  30.32 
 
 		 990 aa  141  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  32.81 
 
 		 1417 aa  142  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  55.88 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  55.88 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  35.06 
 
 		 1342 aa  134  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  34.42 
 
 		 1447 aa  133  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  35.43 
 
 		 1588 aa  132  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  49.15 
 
 		 525 aa  131  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  29.91 
 
 		 1446 aa  131  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  39.25 
 
 		 810 aa  131  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  39.33 
 
 		 877 aa  131  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  43.56 
 
 		 472 aa  127  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  30.29 
 
 		 1674 aa  127  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  48 
 
 		 650 aa  126  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  28.68 
 
 		 1472 aa  124  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  29.45 
 
 		 753 aa  117  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  28.64 
 
 		 1440 aa  116  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  45.64 
 
 		 977 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  35.56 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  33.7 
 
 		 1713 aa  107  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  32.15 
 
 		 880 aa  108  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  26.47 
 
 		 1190 aa  108  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  36.92 
 
 		 459 aa  106  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  36.92 
 
 		 459 aa  106  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  36.92 
 
 		 322 aa  105  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  36.92 
 
 		 459 aa  106  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0463  putative membrane-anchored cell surface protein  36.92 
 
 		 1616 aa  105  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.590511  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1951  membrane-anchored cell surface protein  37.19 
 
 		 1608 aa  105  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  31.73 
 
 		 876 aa  104  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  26.52 
 
 		 2095 aa  103  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0533  YadA-like C-terminal region protein  36.92 
 
 		 229 aa  103  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  31.65 
 
 		 2504 aa  101  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  30.4 
 
 		 878 aa  100  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  35.62 
 
 		 1390 aa  99.4  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  34.31 
 
 		 589 aa  97.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  38.76 
 
 		 1265 aa  97.1  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  41.94 
 
 		 1068 aa  96.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  35.33 
 
 		 766 aa  96.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>