201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4338 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  43.89 
 
 		 3192 aa  1124    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  100 
 
 		 3126 aa  5969    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  45.9 
 
 		 735 aa  460  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  39.22 
 
 		 2832 aa  425  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  35.11 
 
 		 4191 aa  355  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  36.04 
 
 		 4726 aa  345  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  32.62 
 
 		 3718 aa  338  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  35.6 
 
 		 4384 aa  293  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  30.13 
 
 		 1342 aa  253  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  34.03 
 
 		 1072 aa  251  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  33.23 
 
 		 3355 aa  242  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  33.71 
 
 		 963 aa  234  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  33.8 
 
 		 1197 aa  233  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  33.7 
 
 		 1197 aa  233  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  33.7 
 
 		 1197 aa  233  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  29.81 
 
 		 1451 aa  227  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  29.1 
 
 		 1674 aa  213  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  40.48 
 
 		 597 aa  205  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  34.14 
 
 		 1125 aa  203  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  49.01 
 
 		 1246 aa  203  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  38.74 
 
 		 597 aa  202  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  38.74 
 
 		 597 aa  202  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  32.9 
 
 		 1204 aa  201  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  29.71 
 
 		 1447 aa  191  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  27.87 
 
 		 1472 aa  189  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  38.93 
 
 		 1309 aa  187  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  34.77 
 
 		 990 aa  186  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  34.87 
 
 		 967 aa  185  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  29.38 
 
 		 1447 aa  184  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  29.73 
 
 		 1446 aa  183  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  33.18 
 
 		 3635 aa  181  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  35.86 
 
 		 2868 aa  179  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  30.14 
 
 		 1713 aa  179  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  32.25 
 
 		 1613 aa  173  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  33.29 
 
 		 2396 aa  167  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  30.58 
 
 		 1616 aa  162  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  35.01 
 
 		 1417 aa  162  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  33.66 
 
 		 740 aa  154  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  31.17 
 
 		 1122 aa  150  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  31.17 
 
 		 1122 aa  150  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  31.44 
 
 		 1074 aa  150  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  39.29 
 
 		 877 aa  144  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  32.79 
 
 		 766 aa  139  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  27.45 
 
 		 1616 aa  135  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1616 aa  135  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  29.81 
 
 		 878 aa  133  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  33.85 
 
 		 1117 aa  132  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  27.1 
 
 		 1588 aa  129  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  41.85 
 
 		 1440 aa  128  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  41.85 
 
 		 1190 aa  128  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  28.67 
 
 		 753 aa  127  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  37.15 
 
 		 472 aa  127  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  38.57 
 
 		 2157 aa  124  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  39.65 
 
 		 1390 aa  123  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  34.29 
 
 		 1326 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  37.93 
 
 		 810 aa  120  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  40.27 
 
 		 2504 aa  121  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  31.04 
 
 		 880 aa  120  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  37.61 
 
 		 876 aa  118  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  27.39 
 
 		 1814 aa  118  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  29.92 
 
 		 1265 aa  116  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  44.94 
 
 		 536 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  48.73 
 
 		 962 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  44.72 
 
 		 831 aa  114  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  45.09 
 
 		 589 aa  114  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  31.23 
 
 		 1090 aa  113  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  47.27 
 
 		 1068 aa  113  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  31.23 
 
 		 1090 aa  113  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  31.23 
 
 		 1090 aa  113  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  30.71 
 
 		 1122 aa  113  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  44.22 
 
 		 831 aa  113  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  44.22 
 
 		 831 aa  113  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  47.27 
 
 		 1012 aa  113  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  44.85 
 
 		 575 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  44.22 
 
 		 816 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  44.22 
 
 		 820 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  44.22 
 
 		 816 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  44.22 
 
 		 816 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  44.22 
 
 		 816 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  35.13 
 
 		 1549 aa  112  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  48.1 
 
 		 1186 aa  112  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  40.38 
 
 		 716 aa  108  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  40.38 
 
 		 716 aa  107  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  46.05 
 
 		 617 aa  106  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  49.3 
 
 		 423 aa  103  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  34.05 
 
 		 2392 aa  102  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  23.82 
 
 		 2914 aa  102  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  37.34 
 
 		 548 aa  100  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  35.8 
 
 		 827 aa  100  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  33.72 
 
 		 2141 aa  99.8  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  39.9 
 
 		 373 aa  99.8  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  39.9 
 
 		 373 aa  99.8  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  39.9 
 
 		 378 aa  99.8  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  39.09 
 
 		 378 aa  99  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  34.22 
 
 		 1854 aa  99  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  24.51 
 
 		 2078 aa  99.4  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  29.12 
 
 		 655 aa  98.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  39.9 
 
 		 533 aa  98.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  39.09 
 
 		 460 aa  97.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  40 
 
 		 192 aa  96.7  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>