199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6072 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  100 
 
 
1125 aa  2168    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  78.39 
 
 
1451 aa  1234    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  80.58 
 
 
1197 aa  1754    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  80.25 
 
 
1197 aa  1747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  82.61 
 
 
1204 aa  1764    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  80.58 
 
 
1197 aa  1754    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  30.17 
 
 
3192 aa  211  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  34.88 
 
 
4384 aa  207  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  33.18 
 
 
990 aa  204  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  29.45 
 
 
4191 aa  197  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  33.88 
 
 
735 aa  194  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  35.59 
 
 
1326 aa  191  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  36.16 
 
 
3126 aa  187  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  39.55 
 
 
597 aa  187  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  39.55 
 
 
597 aa  187  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  33.73 
 
 
967 aa  187  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  34.08 
 
 
1417 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  38.14 
 
 
597 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  32.91 
 
 
2832 aa  184  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  31.9 
 
 
3635 aa  179  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  31.15 
 
 
2868 aa  173  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  30.43 
 
 
1613 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  28.58 
 
 
1472 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  29.31 
 
 
1447 aa  167  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  28.01 
 
 
3718 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  29.15 
 
 
1447 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  29.14 
 
 
1072 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  28.22 
 
 
1342 aa  157  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  27.04 
 
 
1588 aa  157  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  39.54 
 
 
330 aa  154  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  36.71 
 
 
877 aa  154  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  27.81 
 
 
1446 aa  154  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  36.71 
 
 
1440 aa  153  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  35.93 
 
 
810 aa  152  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  40.19 
 
 
575 aa  152  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  36.46 
 
 
1190 aa  151  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  29.15 
 
 
963 aa  146  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  29.27 
 
 
2157 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  30.41 
 
 
1309 aa  142  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  35.96 
 
 
831 aa  140  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  39.44 
 
 
655 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  34.1 
 
 
820 aa  139  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  34.1 
 
 
816 aa  138  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  34.1 
 
 
816 aa  138  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  34.1 
 
 
816 aa  138  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  34.1 
 
 
816 aa  138  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  34.1 
 
 
831 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  34.1 
 
 
831 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  37.43 
 
 
589 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  49.1 
 
 
1390 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  36.81 
 
 
536 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  47.37 
 
 
2504 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  39.92 
 
 
1117 aa  134  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  27.88 
 
 
753 aa  131  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.04 
 
 
1674 aa  129  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  32.6 
 
 
1616 aa  128  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  36.58 
 
 
716 aa  127  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  32.25 
 
 
1616 aa  126  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  32.25 
 
 
1616 aa  126  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  32.52 
 
 
1549 aa  125  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  36.5 
 
 
898 aa  125  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  42.51 
 
 
356 aa  125  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  36.19 
 
 
716 aa  124  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  46.95 
 
 
472 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  35.11 
 
 
880 aa  123  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  36.19 
 
 
1246 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  35.21 
 
 
876 aa  120  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  36.87 
 
 
1713 aa  119  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  33.33 
 
 
878 aa  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  45.66 
 
 
423 aa  115  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  34.03 
 
 
4726 aa  114  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  34.72 
 
 
279 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  45.38 
 
 
192 aa  102  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  45.38 
 
 
192 aa  102  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  39.24 
 
 
1516 aa  101  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  45.38 
 
 
373 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  30.87 
 
 
1235 aa  101  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  30.94 
 
 
3355 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  45.38 
 
 
378 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  45.38 
 
 
373 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  26.29 
 
 
2092 aa  99.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  47.86 
 
 
533 aa  100  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  34.78 
 
 
1090 aa  98.6  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  34.78 
 
 
1074 aa  99  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  34.78 
 
 
1090 aa  98.6  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  34.78 
 
 
1090 aa  98.6  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  34.78 
 
 
1122 aa  98.6  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  34.78 
 
 
1122 aa  98.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  34.78 
 
 
1122 aa  98.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  48.08 
 
 
378 aa  95.5  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  35.34 
 
 
977 aa  94.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  41.54 
 
 
460 aa  94  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  42.57 
 
 
492 aa  92.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  31.75 
 
 
600 aa  91.3  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  28.8 
 
 
2095 aa  90.1  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  31.86 
 
 
2866 aa  88.2  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  30.12 
 
 
766 aa  87.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  31.09 
 
 
1916 aa  87.4  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  40.48 
 
 
1068 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  40.48 
 
 
962 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>