203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4227 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  100 
 
 
3355 aa  6396    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  42.5 
 
 
4191 aa  1263    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  64.37 
 
 
3718 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  35.06 
 
 
2832 aa  280  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  31.99 
 
 
3126 aa  266  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  35.91 
 
 
4384 aa  245  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  36.63 
 
 
1613 aa  234  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  48.31 
 
 
1072 aa  227  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  37.82 
 
 
877 aa  217  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  39.51 
 
 
810 aa  201  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  30.36 
 
 
1451 aa  185  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  30.96 
 
 
963 aa  180  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  32.08 
 
 
3192 aa  179  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  32.98 
 
 
1246 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  33.18 
 
 
1122 aa  177  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  33.18 
 
 
1122 aa  176  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  33.18 
 
 
1090 aa  176  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  33.18 
 
 
1090 aa  176  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  33.18 
 
 
1090 aa  176  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  33.18 
 
 
1122 aa  176  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  33.18 
 
 
1074 aa  176  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  35.58 
 
 
1265 aa  173  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  55.19 
 
 
1012 aa  168  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  53 
 
 
1068 aa  168  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  54.59 
 
 
1186 aa  168  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  55.19 
 
 
962 aa  167  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  37.29 
 
 
4726 aa  166  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  34.15 
 
 
1117 aa  166  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  38.96 
 
 
1309 aa  162  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  52.1 
 
 
378 aa  157  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  52.1 
 
 
373 aa  157  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  52.1 
 
 
373 aa  157  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  52.1 
 
 
192 aa  156  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  52.1 
 
 
192 aa  156  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  45.74 
 
 
533 aa  154  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  29.98 
 
 
1197 aa  152  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  29.72 
 
 
1197 aa  152  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  29.72 
 
 
1197 aa  152  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  44.79 
 
 
378 aa  151  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  30.78 
 
 
1204 aa  151  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  35.62 
 
 
827 aa  150  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  44.79 
 
 
460 aa  150  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  30.96 
 
 
1125 aa  148  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  38.18 
 
 
597 aa  147  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  38.18 
 
 
597 aa  147  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  38.18 
 
 
597 aa  147  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  48.31 
 
 
1654 aa  146  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  36.79 
 
 
548 aa  145  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  36.47 
 
 
575 aa  145  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  40 
 
 
715 aa  141  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  40 
 
 
1626 aa  140  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  29.43 
 
 
1516 aa  140  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  46.63 
 
 
1766 aa  140  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  46.63 
 
 
1705 aa  140  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  46.63 
 
 
1669 aa  140  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  46.63 
 
 
1535 aa  140  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  49.4 
 
 
1326 aa  139  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  31.52 
 
 
967 aa  139  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  52.94 
 
 
2141 aa  137  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  33.71 
 
 
2868 aa  135  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  49.69 
 
 
617 aa  135  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  45.45 
 
 
525 aa  134  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  52.54 
 
 
3635 aa  134  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  34.51 
 
 
735 aa  129  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  49.02 
 
 
737 aa  127  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  27.64 
 
 
1333 aa  127  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  50.68 
 
 
135 aa  127  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  50.68 
 
 
135 aa  127  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  36.18 
 
 
536 aa  126  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  30.09 
 
 
2095 aa  126  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  28.18 
 
 
1342 aa  124  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  30.79 
 
 
831 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  30.79 
 
 
831 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  33.4 
 
 
2392 aa  122  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  41.87 
 
 
820 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  34.24 
 
 
655 aa  121  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  41.87 
 
 
816 aa  122  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  41.87 
 
 
816 aa  122  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  41.87 
 
 
816 aa  122  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  41.87 
 
 
816 aa  122  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  36.16 
 
 
997 aa  120  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  41.52 
 
 
831 aa  119  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  39.64 
 
 
1440 aa  117  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  31.86 
 
 
880 aa  117  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  30.99 
 
 
876 aa  116  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  42.61 
 
 
650 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  39.27 
 
 
1190 aa  114  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  31.46 
 
 
1417 aa  114  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  35.11 
 
 
589 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  28.86 
 
 
691 aa  112  9.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  27.13 
 
 
1411 aa  111  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  25 
 
 
1230 aa  111  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  35.39 
 
 
1616 aa  108  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  35.39 
 
 
1616 aa  108  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  35.39 
 
 
1616 aa  108  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  29.6 
 
 
1713 aa  107  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  27.85 
 
 
753 aa  107  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  31.38 
 
 
989 aa  106  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  34.38 
 
 
472 aa  102  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  31.14 
 
 
1549 aa  100  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>