197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0544 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  44.75 
 
 		 1265 aa  674    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  100 
 
 		 2392 aa  4405    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0855  outer membrane protein XadA  37.68 
 
 		 815 aa  311  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.912116  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  40.51 
 
 		 827 aa  305  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  51.45 
 
 		 989 aa  274  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  48.81 
 
 		 997 aa  244  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  39.66 
 
 		 737 aa  235  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  39.17 
 
 		 617 aa  231  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  31.83 
 
 		 2868 aa  221  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  37.73 
 
 		 1186 aa  218  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  39.4 
 
 		 1068 aa  207  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  39.7 
 
 		 1012 aa  202  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  33.17 
 
 		 4384 aa  197  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  37.76 
 
 		 877 aa  193  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  37.35 
 
 		 810 aa  177  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  34.97 
 
 		 4191 aa  170  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  28.09 
 
 		 1516 aa  162  9e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  38.67 
 
 		 601 aa  159  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  31.85 
 
 		 597 aa  154  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  31.85 
 
 		 597 aa  154  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  31.94 
 
 		 597 aa  154  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  37.34 
 
 		 548 aa  147  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  36.21 
 
 		 650 aa  147  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  36.13 
 
 		 536 aa  140  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  31.29 
 
 		 1713 aa  139  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  25.32 
 
 		 1333 aa  139  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  36.77 
 
 		 3355 aa  137  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  33.62 
 
 		 1117 aa  137  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  29.58 
 
 		 2095 aa  130  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  39.37 
 
 		 962 aa  130  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  35.49 
 
 		 1613 aa  129  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  34.29 
 
 		 2157 aa  129  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 		 831 aa  127  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 		 831 aa  127  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 		 816 aa  127  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 		 820 aa  127  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 		 816 aa  127  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 		 816 aa  127  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 		 816 aa  127  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  31.31 
 
 		 1814 aa  127  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  36.79 
 
 		 1616 aa  126  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  36.79 
 
 		 1616 aa  126  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  29.54 
 
 		 4726 aa  125  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  34.47 
 
 		 1654 aa  123  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  24.39 
 
 		 1230 aa  123  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  35.05 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  33.08 
 
 		 575 aa  119  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  36.2 
 
 		 1588 aa  119  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  34.32 
 
 		 3718 aa  119  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  28.16 
 
 		 1411 aa  118  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  37.74 
 
 		 1072 aa  117  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  32.18 
 
 		 876 aa  115  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  32.57 
 
 		 880 aa  115  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  34.34 
 
 		 735 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  30.54 
 
 		 878 aa  114  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  31.56 
 
 		 831 aa  112  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  37.23 
 
 		 3126 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  30.63 
 
 		 990 aa  112  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  34.44 
 
 		 655 aa  111  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  33.15 
 
 		 1487 aa  111  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  33.71 
 
 		 1616 aa  110  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  34.42 
 
 		 1246 aa  110  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  33.43 
 
 		 1434 aa  109  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  34.95 
 
 		 898 aa  108  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  34.58 
 
 		 1471 aa  107  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  34.58 
 
 		 1471 aa  107  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  42.13 
 
 		 1440 aa  106  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  42.13 
 
 		 1190 aa  106  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  34.78 
 
 		 3192 aa  105  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  32.01 
 
 		 691 aa  105  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  38.78 
 
 		 192 aa  105  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  38.78 
 
 		 192 aa  105  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  36.6 
 
 		 378 aa  104  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  40.1 
 
 		 3635 aa  104  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  38.78 
 
 		 373 aa  103  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  38.78 
 
 		 373 aa  103  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  38.78 
 
 		 378 aa  103  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  39.5 
 
 		 2504 aa  103  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  36.08 
 
 		 460 aa  102  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  39 
 
 		 1390 aa  101  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  35.14 
 
 		 1854 aa  99.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  39.31 
 
 		 418 aa  99.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  28.8 
 
 		 740 aa  99.4  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  32.48 
 
 		 716 aa  99  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  35.12 
 
 		 1353 aa  99.4  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  32.61 
 
 		 716 aa  97.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  34.06 
 
 		 1535 aa  97.1  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  25.29 
 
 		 1065 aa  97.1  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  34.43 
 
 		 715 aa  96.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  29.61 
 
 		 2396 aa  96.3  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  50.82 
 
 		 472 aa  96.3  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  34.06 
 
 		 1766 aa  96.3  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  31.14 
 
 		 600 aa  95.9  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  34.06 
 
 		 1705 aa  95.9  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  34.06 
 
 		 1626 aa  95.9  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  28.83 
 
 		 2866 aa  95.9  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  34.12 
 
 		 1674 aa  95.9  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  34.8 
 
 		 423 aa  95.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  35.97 
 
 		 1549 aa  94.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  55.43 
 
 		 1197 aa  94  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>