191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3661 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  100 
 
 		 418 aa  794    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  48.77 
 
 		 601 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  40.34 
 
 		 1068 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  40.82 
 
 		 1012 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  39.77 
 
 		 962 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  39.12 
 
 		 1186 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  42.94 
 
 		 1072 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  41.82 
 
 		 1535 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  40.14 
 
 		 2392 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  36.54 
 
 		 1549 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  39.54 
 
 		 715 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  39.54 
 
 		 1626 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  39.54 
 
 		 1705 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  39.54 
 
 		 1669 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2844  Hep_Hag repeat-containing protein  35.86 
 
 		 506 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341394  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  39.54 
 
 		 1766 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  36.98 
 
 		 536 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  43.09 
 
 		 1654 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  35.42 
 
 		 617 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  38.44 
 
 		 737 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  39.05 
 
 		 827 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  41.89 
 
 		 597 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  40.26 
 
 		 3192 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  41.89 
 
 		 597 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  41.89 
 
 		 597 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  38.68 
 
 		 3355 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  40.91 
 
 		 2832 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  35.42 
 
 		 548 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  35.38 
 
 		 831 aa  94.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  44.3 
 
 		 967 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  38.51 
 
 		 589 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  45.58 
 
 		 831 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  45.58 
 
 		 831 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  40.52 
 
 		 3126 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  45.58 
 
 		 816 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  45.58 
 
 		 820 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  45.58 
 
 		 816 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  45.58 
 
 		 816 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  45.58 
 
 		 816 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  36.53 
 
 		 877 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  31.13 
 
 		 655 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  36.05 
 
 		 575 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  30.97 
 
 		 1516 aa  90.1  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  43.75 
 
 		 1417 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  34.25 
 
 		 810 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  30.5 
 
 		 1390 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  32.06 
 
 		 1190 aa  88.2  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  32.13 
 
 		 1440 aa  86.3  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  39.58 
 
 		 2504 aa  86.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  34.59 
 
 		 1613 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  34.45 
 
 		 1265 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  39.61 
 
 		 2868 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  41.61 
 
 		 4384 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  30.94 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  32.33 
 
 		 1616 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  32.33 
 
 		 1616 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1616 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  35.14 
 
 		 1309 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  31.7 
 
 		 691 aa  79.3  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  31.39 
 
 		 1588 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  30.77 
 
 		 1230 aa  79  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  33.96 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  33.96 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  33.33 
 
 		 1674 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  30.29 
 
 		 1411 aa  77  0.0000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  33.63 
 
 		 650 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  34.16 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  36.91 
 
 		 1326 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  36.42 
 
 		 3635 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  34.16 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  51.22 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  32.08 
 
 		 990 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  34.16 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  43.56 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  28.57 
 
 		 1916 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  34.74 
 
 		 600 aa  75.1  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  32.06 
 
 		 1117 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  39.44 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  41.49 
 
 		 1197 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  31.5 
 
 		 880 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  35.29 
 
 		 1472 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  41.49 
 
 		 1197 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  41.49 
 
 		 1197 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  27.65 
 
 		 1333 aa  72.8  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  39.44 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  35.45 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  32 
 
 		 876 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  39.89 
 
 		 1204 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  39.89 
 
 		 1125 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  31.56 
 
 		 1405 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  42.42 
 
 		 3718 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  38.81 
 
 		 533 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  55.26 
 
 		 4726 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  29.45 
 
 		 4238 aa  67.4  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  32.09 
 
 		 1471 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  32.09 
 
 		 1471 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  39.78 
 
 		 1451 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  50.65 
 
 		 1713 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  50.67 
 
 		 1446 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  50.67 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>