205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2793 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  100 
 
 		 601 aa  1107    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  42.52 
 
 		 1068 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  43.07 
 
 		 1012 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  43.25 
 
 		 962 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  40.26 
 
 		 1186 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  47.54 
 
 		 617 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  47.51 
 
 		 827 aa  240  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  44.19 
 
 		 737 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  48.77 
 
 		 418 aa  220  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  37.5 
 
 		 548 aa  158  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  36.84 
 
 		 1616 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  36.84 
 
 		 1616 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1616 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  39.88 
 
 		 2392 aa  150  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  42.48 
 
 		 810 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  39.41 
 
 		 650 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  34.72 
 
 		 1265 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  34.36 
 
 		 1613 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  38.03 
 
 		 2095 aa  134  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  36.1 
 
 		 1654 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2844  Hep_Hag repeat-containing protein  38.52 
 
 		 506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341394  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  36.45 
 
 		 1588 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  34.98 
 
 		 536 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  35.89 
 
 		 1471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  35.89 
 
 		 1471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  36.36 
 
 		 2868 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  40.79 
 
 		 1674 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  35.89 
 
 		 1546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  34.82 
 
 		 575 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  35.76 
 
 		 1854 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  29.88 
 
 		 1516 aa  117  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  32.16 
 
 		 691 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  32.16 
 
 		 877 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  33.07 
 
 		 655 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  42.06 
 
 		 1535 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  42.06 
 
 		 715 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  42.06 
 
 		 1626 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  42.06 
 
 		 1766 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  42.06 
 
 		 1705 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  42.06 
 
 		 1669 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  42.13 
 
 		 1072 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  33.52 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  32.85 
 
 		 831 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  32.85 
 
 		 831 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  32.91 
 
 		 816 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  32.91 
 
 		 820 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  32.91 
 
 		 816 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  32.91 
 
 		 816 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  32.91 
 
 		 816 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  35.79 
 
 		 1353 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  36.23 
 
 		 831 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  39.92 
 
 		 2866 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  42.41 
 
 		 2493 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  36.39 
 
 		 3718 aa  97.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  35.76 
 
 		 1190 aa  95.9  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  40.51 
 
 		 597 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  41.08 
 
 		 3635 aa  94  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  40.51 
 
 		 597 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  40.51 
 
 		 597 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  40.81 
 
 		 898 aa  94  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  35.39 
 
 		 1117 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  35.45 
 
 		 1440 aa  92.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  31.67 
 
 		 1230 aa  92.4  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  32.63 
 
 		 4191 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  32.76 
 
 		 492 aa  92  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  29.74 
 
 		 600 aa  91.7  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  36.21 
 
 		 1814 aa  91.3  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  42.47 
 
 		 967 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  34.27 
 
 		 3355 aa  90.5  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  35.82 
 
 		 1434 aa  90.1  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  38.35 
 
 		 1204 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  40.3 
 
 		 1487 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  27.41 
 
 		 1411 aa  89.4  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2138  hypothetical protein  35.71 
 
 		 206 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  39.92 
 
 		 2141 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  38.06 
 
 		 1197 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  38.06 
 
 		 1197 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  38.06 
 
 		 1197 aa  87.8  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  33.55 
 
 		 1390 aa  86.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  32.93 
 
 		 2504 aa  85.9  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  37.59 
 
 		 1125 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  41.7 
 
 		 2814 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  37.04 
 
 		 4384 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  32.92 
 
 		 2832 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  38 
 
 		 3126 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  39.34 
 
 		 1417 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  40.85 
 
 		 735 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  33.33 
 
 		 3192 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  37.43 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  37.04 
 
 		 1309 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  35.79 
 
 		 378 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  44.54 
 
 		 1326 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  46.67 
 
 		 525 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  40.09 
 
 		 2728 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  33.86 
 
 		 386 aa  79.7  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  27.93 
 
 		 1333 aa  80.1  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  40.09 
 
 		 2778 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  38.8 
 
 		 989 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  33.45 
 
 		 2396 aa  78.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  34.97 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>