214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6201 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  86.54 
 
 		 1854 aa  1113    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  79.3 
 
 		 1487 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  91.77 
 
 		 1546 aa  1025    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  87.27 
 
 		 1471 aa  1065    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  100 
 
 		 1353 aa  2506    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  87.27 
 
 		 1471 aa  1065    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  57.95 
 
 		 1117 aa  549  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  65.38 
 
 		 2141 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  73 
 
 		 1434 aa  493  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  42.79 
 
 		 2396 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  40.02 
 
 		 2814 aa  347  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  39.44 
 
 		 2778 aa  343  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  40.29 
 
 		 2728 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  60.5 
 
 		 2025 aa  299  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  51.13 
 
 		 977 aa  295  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  61.03 
 
 		 330 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  53.35 
 
 		 1916 aa  283  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  58.23 
 
 		 2757 aa  281  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  46.08 
 
 		 1654 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  55.04 
 
 		 2866 aa  272  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  40.86 
 
 		 1669 aa  270  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  40.17 
 
 		 2505 aa  262  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  56.55 
 
 		 898 aa  262  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  45.18 
 
 		 1705 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  41.99 
 
 		 1626 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  37.2 
 
 		 1766 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  30.99 
 
 		 1122 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  30.91 
 
 		 1122 aa  238  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  30.72 
 
 		 1122 aa  238  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  30.72 
 
 		 1090 aa  237  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  30.72 
 
 		 1090 aa  237  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  30.72 
 
 		 1090 aa  237  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  39.62 
 
 		 1535 aa  236  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  32.63 
 
 		 1074 aa  225  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2042  putative cell surface protein  69.09 
 
 		 365 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  62.66 
 
 		 2493 aa  221  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  66.13 
 
 		 715 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  31.29 
 
 		 1472 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  31.37 
 
 		 1447 aa  195  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  31.25 
 
 		 1446 aa  195  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  31.97 
 
 		 1616 aa  195  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  31.97 
 
 		 1588 aa  194  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  43.3 
 
 		 716 aa  193  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  31.07 
 
 		 1447 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  42.78 
 
 		 716 aa  190  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  31.29 
 
 		 1674 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  31.25 
 
 		 1616 aa  186  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1616 aa  186  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.92 
 
 		 1549 aa  178  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  42.01 
 
 		 1417 aa  172  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  34.29 
 
 		 876 aa  169  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  34.46 
 
 		 880 aa  167  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  34.21 
 
 		 962 aa  166  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  39.27 
 
 		 1068 aa  165  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  35.57 
 
 		 831 aa  164  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  35.57 
 
 		 831 aa  164  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  35.57 
 
 		 816 aa  164  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  35.57 
 
 		 816 aa  163  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  35.57 
 
 		 816 aa  163  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  35.57 
 
 		 816 aa  163  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  35.57 
 
 		 820 aa  163  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  36.61 
 
 		 831 aa  161  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  39.72 
 
 		 1012 aa  161  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  35.77 
 
 		 2095 aa  160  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  37.55 
 
 		 617 aa  159  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  39.55 
 
 		 1326 aa  157  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  31.09 
 
 		 1411 aa  157  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  37.55 
 
 		 1186 aa  156  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  37.6 
 
 		 827 aa  155  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  44.35 
 
 		 753 aa  155  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  34.43 
 
 		 4384 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  33.78 
 
 		 878 aa  149  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  33.51 
 
 		 877 aa  148  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  35.88 
 
 		 472 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  34.71 
 
 		 1309 aa  141  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  37.22 
 
 		 601 aa  140  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  36.04 
 
 		 1190 aa  138  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0463  putative membrane-anchored cell surface protein  50 
 
 		 1616 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.590511  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  31.14 
 
 		 1230 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1951  membrane-anchored cell surface protein  50 
 
 		 1608 aa  136  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  36.13 
 
 		 2868 aa  135  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  26.91 
 
 		 1333 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  31.93 
 
 		 691 aa  134  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  33.77 
 
 		 575 aa  134  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  50 
 
 		 459 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  42.23 
 
 		 492 aa  131  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  50 
 
 		 459 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  50 
 
 		 459 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  50 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  45 
 
 		 533 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  44.5 
 
 		 373 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  44.5 
 
 		 373 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  44.5 
 
 		 378 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  44.44 
 
 		 192 aa  127  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  44.44 
 
 		 192 aa  127  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  32.08 
 
 		 3635 aa  126  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0533  YadA-like C-terminal region protein  50 
 
 		 229 aa  125  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  31.08 
 
 		 735 aa  125  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  34.14 
 
 		 1390 aa  124  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  33.18 
 
 		 4726 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>