193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03061 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  100 
 
 
989 aa  1891    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  49.31 
 
 
1265 aa  590  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  34.35 
 
 
997 aa  308  5.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0855  outer membrane protein XadA  44.85 
 
 
815 aa  203  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.912116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  57.59 
 
 
2392 aa  193  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  32.21 
 
 
827 aa  157  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  31.54 
 
 
3355 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  32 
 
 
877 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  31.66 
 
 
2832 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  34.17 
 
 
589 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  30.17 
 
 
2095 aa  104  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  28.07 
 
 
1333 aa  103  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  54.29 
 
 
423 aa  103  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  33.86 
 
 
737 aa  102  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  32.35 
 
 
617 aa  102  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  37.29 
 
 
3718 aa  101  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  31.63 
 
 
1068 aa  100  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  40.61 
 
 
536 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  25.78 
 
 
1230 aa  99.4  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  31.37 
 
 
1814 aa  98.6  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  35.03 
 
 
548 aa  97.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  44.59 
 
 
575 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  27.6 
 
 
4191 aa  96.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  32.83 
 
 
1549 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  35.09 
 
 
963 aa  95.9  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  33.09 
 
 
1246 aa  93.2  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  28.4 
 
 
1516 aa  93.2  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  30.16 
 
 
735 aa  91.3  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  35.42 
 
 
2157 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  53.33 
 
 
472 aa  90.9  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  34.24 
 
 
962 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  34.67 
 
 
1072 aa  90.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  48.31 
 
 
1197 aa  88.6  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  48.31 
 
 
1197 aa  88.6  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  48.31 
 
 
1197 aa  88.6  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  47.66 
 
 
880 aa  88.2  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  30.66 
 
 
473 aa  87.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  50 
 
 
1440 aa  87.4  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  45.79 
 
 
876 aa  86.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  25.5 
 
 
1065 aa  86.3  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  39.29 
 
 
655 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  36.69 
 
 
2504 aa  85.5  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  47.06 
 
 
1390 aa  84.7  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  29.65 
 
 
1616 aa  84.7  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  29.57 
 
 
1616 aa  84.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  49.07 
 
 
1309 aa  84.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  45.45 
 
 
1012 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  29.57 
 
 
1616 aa  84.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  49.45 
 
 
356 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  34.2 
 
 
4384 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  49.14 
 
 
810 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  46.09 
 
 
1204 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  46.09 
 
 
1125 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  46.02 
 
 
1451 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  44.76 
 
 
1186 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  30.51 
 
 
691 aa  82  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  33.8 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  33.8 
 
 
460 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  60.81 
 
 
3126 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  31.18 
 
 
3192 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  26.56 
 
 
1411 aa  80.5  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  32.98 
 
 
3635 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  48.28 
 
 
878 aa  80.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  33.67 
 
 
601 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  47.52 
 
 
990 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.05 
 
 
1588 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  37.5 
 
 
597 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  37.5 
 
 
597 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  37.5 
 
 
597 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  31.31 
 
 
716 aa  78.2  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  32.24 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  32.24 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  32.39 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  34.22 
 
 
1654 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  30.71 
 
 
565 aa  77.4  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  42.66 
 
 
330 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  31.71 
 
 
192 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  31.71 
 
 
192 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  30.23 
 
 
2868 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  26.91 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  31.74 
 
 
1674 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  31.31 
 
 
716 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  63.49 
 
 
4726 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  39.1 
 
 
1472 aa  73.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  42.73 
 
 
831 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  42.73 
 
 
831 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  42.73 
 
 
831 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  42.73 
 
 
816 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  42.73 
 
 
820 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  42.73 
 
 
816 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  42.73 
 
 
816 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  42.73 
 
 
816 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  31.96 
 
 
533 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  31.16 
 
 
1434 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  34.38 
 
 
1342 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  27.09 
 
 
4526 aa  69.7  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  32.02 
 
 
650 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  28.55 
 
 
1117 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  34.38 
 
 
1446 aa  68.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  34.38 
 
 
1447 aa  68.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>