145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1341 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  100 
 
 
563 aa  1106    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  70.63 
 
 
565 aa  766    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  45.57 
 
 
1230 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  60.71 
 
 
1333 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  44.68 
 
 
1065 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  36.68 
 
 
572 aa  261  4e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  64.86 
 
 
1212 aa  250  5e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  70.86 
 
 
691 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  71.26 
 
 
600 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  38.24 
 
 
601 aa  209  9e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  50.83 
 
 
1411 aa  209  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  67.88 
 
 
998 aa  192  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  63.52 
 
 
1014 aa  192  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  63.95 
 
 
1813 aa  177  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  46.43 
 
 
2078 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  46.43 
 
 
2078 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  46.43 
 
 
2073 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  46.43 
 
 
2091 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  45.52 
 
 
2092 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  44.83 
 
 
2075 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  29.81 
 
 
551 aa  93.2  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  33.33 
 
 
1516 aa  90.5  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  27.75 
 
 
1259 aa  90.5  8e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  26.63 
 
 
1472 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  29.31 
 
 
1713 aa  81.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  25.96 
 
 
1446 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  30.9 
 
 
2914 aa  80.1  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  28.86 
 
 
599 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  32.47 
 
 
1616 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  32.47 
 
 
1616 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  32.47 
 
 
1616 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  30.09 
 
 
1197 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  30.41 
 
 
1197 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  30.41 
 
 
1197 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  29.89 
 
 
1451 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  35.89 
 
 
1588 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  26.34 
 
 
1613 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  26.46 
 
 
735 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  31.42 
 
 
2095 aa  71.6  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  36.52 
 
 
597 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  36.52 
 
 
597 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  30.54 
 
 
1405 aa  70.9  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  30.42 
 
 
597 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  28.38 
 
 
4191 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  28.53 
 
 
1549 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  34.69 
 
 
650 aa  67  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  37.13 
 
 
3718 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  26.76 
 
 
4238 aa  65.1  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  30 
 
 
1434 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  31.37 
 
 
1854 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  27.5 
 
 
1674 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  42.99 
 
 
5143 aa  63.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  27.36 
 
 
4526 aa  63.5  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  30.69 
 
 
1204 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  29.51 
 
 
2396 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  33.51 
 
 
2906 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  34.05 
 
 
279 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  32.61 
 
 
1814 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  30.69 
 
 
1125 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  44 
 
 
2504 aa  62.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  45.21 
 
 
1390 aa  62  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  46.58 
 
 
1440 aa  62  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  31.35 
 
 
595 aa  61.6  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  60.87 
 
 
1235 aa  61.6  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  46.58 
 
 
1190 aa  61.6  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  27.47 
 
 
3355 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  30.62 
 
 
827 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  26.91 
 
 
3920 aa  60.8  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  27.13 
 
 
989 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  59.26 
 
 
3554 aa  59.7  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  28.93 
 
 
877 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  36.11 
 
 
330 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  29.61 
 
 
386 aa  58.9  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  29.39 
 
 
3635 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  27.6 
 
 
4384 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  26.22 
 
 
492 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  30.67 
 
 
617 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  31.94 
 
 
2141 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  29.47 
 
 
2392 aa  57.4  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  33.62 
 
 
1471 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  33.62 
 
 
1471 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  33.62 
 
 
1546 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  29.44 
 
 
2157 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  25.47 
 
 
1117 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  28.29 
 
 
4726 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  24.86 
 
 
810 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  36.52 
 
 
1072 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  25.64 
 
 
2832 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  28.65 
 
 
1916 aa  54.7  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  27.54 
 
 
1487 aa  54.3  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  33.07 
 
 
2505 aa  53.5  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  27.24 
 
 
404 aa  53.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  25.38 
 
 
3737 aa  53.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  39.19 
 
 
536 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  23.92 
 
 
3126 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  26.42 
 
 
1654 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  31.09 
 
 
1265 aa  51.6  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  30.16 
 
 
753 aa  51.2  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  28.37 
 
 
3192 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  25.71 
 
 
816 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>