176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0171 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  100 
 
 
1212 aa  2355    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  50.22 
 
 
1411 aa  1056    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  56.37 
 
 
595 aa  398  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  60.84 
 
 
572 aa  346  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  46.14 
 
 
1230 aa  338  3.9999999999999995e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  61.64 
 
 
1333 aa  279  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  59.09 
 
 
563 aa  261  4e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  61.88 
 
 
565 aa  258  4e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  61.42 
 
 
600 aa  229  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  60.41 
 
 
691 aa  229  3e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  54.59 
 
 
601 aa  207  7e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  64.14 
 
 
1813 aa  196  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  65.25 
 
 
1014 aa  191  7e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  34.4 
 
 
998 aa  184  9.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  44.8 
 
 
1065 aa  164  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  36.93 
 
 
1916 aa  122  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  41.96 
 
 
2073 aa  115  7.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  41.96 
 
 
2078 aa  115  7.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  41.96 
 
 
2078 aa  114  9e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  41.96 
 
 
2091 aa  113  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  42.66 
 
 
2092 aa  111  7.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  34.67 
 
 
492 aa  108  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  44.06 
 
 
2075 aa  109  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  30.83 
 
 
1616 aa  108  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  30.83 
 
 
1616 aa  108  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  30.83 
 
 
1616 aa  107  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  27.03 
 
 
2157 aa  104  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.26 
 
 
1588 aa  102  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  30.13 
 
 
655 aa  97.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  34.98 
 
 
737 aa  96.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  30.4 
 
 
3737 aa  96.3  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  32.5 
 
 
1654 aa  95.5  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  33.33 
 
 
1012 aa  95.1  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  27.43 
 
 
1546 aa  94  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 
1613 aa  92.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  28.75 
 
 
650 aa  92.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  34.47 
 
 
962 aa  91.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  34.5 
 
 
617 aa  91.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  25.22 
 
 
1190 aa  91.3  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  32.78 
 
 
831 aa  90.1  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  32.78 
 
 
831 aa  90.1  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  35.64 
 
 
898 aa  90.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  32.78 
 
 
820 aa  89.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  32.78 
 
 
816 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  30.97 
 
 
1434 aa  89.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  32.78 
 
 
816 aa  89.4  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  32.78 
 
 
816 aa  89.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  32.78 
 
 
816 aa  89.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  27.91 
 
 
1117 aa  89  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  28.18 
 
 
4238 aa  88.6  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  34 
 
 
2814 aa  88.6  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  25.13 
 
 
1440 aa  88.2  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  29.78 
 
 
1516 aa  87.8  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  31.99 
 
 
2396 aa  87  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  32.98 
 
 
2505 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  34.07 
 
 
827 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  34.34 
 
 
2493 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  30.36 
 
 
3078 aa  85.5  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  35.79 
 
 
1186 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  27.42 
 
 
1674 aa  82.4  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  30.9 
 
 
2141 aa  82  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  28.24 
 
 
1353 aa  82  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  32.47 
 
 
1068 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  30.19 
 
 
5143 aa  80.9  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  30.67 
 
 
1487 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  32.29 
 
 
1854 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  37.76 
 
 
4384 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  33.67 
 
 
2778 aa  79.7  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  26.55 
 
 
1259 aa  79.7  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  33.67 
 
 
2728 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  31.18 
 
 
831 aa  79  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  43.33 
 
 
740 aa  78.6  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  34.62 
 
 
1814 aa  78.6  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  47.37 
 
 
2757 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  32.15 
 
 
2392 aa  77.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  47.37 
 
 
1916 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  43.33 
 
 
766 aa  77.4  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  31.23 
 
 
2095 aa  77.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  33.85 
 
 
386 aa  77.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  28.65 
 
 
1549 aa  75.5  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  28.98 
 
 
548 aa  75.5  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  43.38 
 
 
2025 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  43.09 
 
 
2866 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  30.46 
 
 
877 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  29.43 
 
 
536 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  34.47 
 
 
575 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  31.1 
 
 
3355 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  32.22 
 
 
601 aa  72.4  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  32.15 
 
 
404 aa  70.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  28.33 
 
 
4526 aa  71.6  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  29.56 
 
 
1705 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  29.56 
 
 
1669 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  29.56 
 
 
1766 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  29.56 
 
 
1535 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  29.29 
 
 
1626 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  31.42 
 
 
1471 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  31.42 
 
 
1471 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  28.22 
 
 
1265 aa  70.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  32.51 
 
 
1405 aa  69.7  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  28.39 
 
 
1472 aa  68.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>