174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1485 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  75.83 
 
 
595 aa  815    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  100 
 
 
572 aa  1107    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  59.55 
 
 
1212 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  62.86 
 
 
1411 aa  326  6e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  37.32 
 
 
600 aa  318  1e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  36.96 
 
 
691 aa  300  5e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  49.07 
 
 
1065 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  57.38 
 
 
1333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  36.68 
 
 
563 aa  252  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  45.87 
 
 
1230 aa  239  8e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  37.11 
 
 
601 aa  209  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  59.46 
 
 
565 aa  207  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  58.16 
 
 
1813 aa  157  6e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  48.77 
 
 
1014 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  60.71 
 
 
998 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  31.05 
 
 
536 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  41.13 
 
 
2866 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  31.33 
 
 
575 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  36.51 
 
 
1916 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  41.53 
 
 
2814 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  40.74 
 
 
898 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  41.92 
 
 
1117 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  41.53 
 
 
2728 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  41.53 
 
 
2778 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  40.3 
 
 
2505 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  31.17 
 
 
589 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  41.91 
 
 
2092 aa  98.6  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  41.91 
 
 
2075 aa  98.6  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  45.37 
 
 
2073 aa  97.8  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  45.37 
 
 
2078 aa  97.4  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  45.37 
 
 
2078 aa  97.4  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  45.37 
 
 
2091 aa  97.4  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  38.55 
 
 
1654 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  31.96 
 
 
655 aa  94.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  39.26 
 
 
2493 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  33.21 
 
 
1814 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  36.91 
 
 
3635 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  37.44 
 
 
1405 aa  88.6  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  33.9 
 
 
404 aa  87.8  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  33.09 
 
 
386 aa  87.4  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  31.32 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  34.66 
 
 
1516 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  35.86 
 
 
2396 aa  84.3  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  44.53 
 
 
766 aa  84  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  28.55 
 
 
2157 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  43.8 
 
 
740 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  35.14 
 
 
1487 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  35.81 
 
 
4726 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  32.5 
 
 
1549 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  33.33 
 
 
2392 aa  80.5  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  48.45 
 
 
2025 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  30.67 
 
 
1674 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  49.48 
 
 
2757 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  49.48 
 
 
1916 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  38.56 
 
 
2141 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  32.56 
 
 
1613 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  35.8 
 
 
1535 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  31.42 
 
 
2868 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  35.8 
 
 
1705 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  35.8 
 
 
1669 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  35.8 
 
 
1766 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  32.41 
 
 
1090 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  32.41 
 
 
1074 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  32.41 
 
 
1090 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  32.41 
 
 
1090 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  32.41 
 
 
1122 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  32.41 
 
 
1122 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  32.41 
 
 
1122 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  48.98 
 
 
977 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  40.88 
 
 
1471 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  40.88 
 
 
1471 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  33.45 
 
 
1265 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  28.9 
 
 
1616 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  38.81 
 
 
1626 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  28.9 
 
 
1616 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  38.22 
 
 
1854 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  37 
 
 
601 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  38.81 
 
 
715 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  34.34 
 
 
2095 aa  74.7  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  32.25 
 
 
4191 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  40.33 
 
 
1546 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  37.66 
 
 
1353 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  36.33 
 
 
4384 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  31.6 
 
 
810 aa  72  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  30.58 
 
 
1616 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  38.92 
 
 
4238 aa  71.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  32.95 
 
 
1451 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  32.51 
 
 
2914 aa  70.5  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  29.81 
 
 
831 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  30.5 
 
 
831 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  30.5 
 
 
831 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  30.5 
 
 
816 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  30.5 
 
 
820 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  30.5 
 
 
816 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  30.5 
 
 
816 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  30.5 
 
 
816 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  36.5 
 
 
1068 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  37.45 
 
 
1012 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  51.35 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  51.35 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>