185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1486 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  100 
 
 
1065 aa  2074    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  63.81 
 
 
1230 aa  756    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  46.69 
 
 
1411 aa  328  4.0000000000000003e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  46.17 
 
 
1212 aa  321  5e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  50.13 
 
 
595 aa  302  2e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  48.8 
 
 
572 aa  284  6.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  62.95 
 
 
563 aa  265  4e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  68.4 
 
 
565 aa  265  4e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  80.77 
 
 
1813 aa  244  6e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  60.54 
 
 
600 aa  239  2e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  57.14 
 
 
601 aa  212  3e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  68.57 
 
 
1014 aa  190  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  65.22 
 
 
998 aa  178  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  39.79 
 
 
691 aa  162  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  40.15 
 
 
1333 aa  147  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  30.45 
 
 
2814 aa  135  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  34.23 
 
 
1916 aa  133  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  30.78 
 
 
2396 aa  128  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  27.35 
 
 
1516 aa  125  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  30.2 
 
 
2728 aa  125  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  30.2 
 
 
2778 aa  125  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  29.06 
 
 
2866 aa  122  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  40.54 
 
 
2505 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  34.49 
 
 
655 aa  118  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  32.69 
 
 
1549 aa  115  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  39.8 
 
 
2493 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  30.13 
 
 
575 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  34.67 
 
 
2141 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  36.91 
 
 
1654 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  37.45 
 
 
1535 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  37.45 
 
 
1766 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  37.66 
 
 
1705 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  25.61 
 
 
1090 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  37.04 
 
 
1626 aa  110  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  25.61 
 
 
1090 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  25.61 
 
 
1090 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  25.37 
 
 
1122 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  37.04 
 
 
1669 aa  110  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  25.37 
 
 
1122 aa  110  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  38.58 
 
 
898 aa  110  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  25.37 
 
 
1122 aa  109  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  25.61 
 
 
1074 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  30.29 
 
 
589 aa  108  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  43.38 
 
 
2078 aa  108  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  43.38 
 
 
2078 aa  108  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  43.38 
 
 
2073 aa  108  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  43.7 
 
 
2091 aa  108  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  45.52 
 
 
2092 aa  108  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  48.85 
 
 
766 aa  107  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  29.4 
 
 
1326 aa  105  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  36.53 
 
 
492 aa  105  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  44.78 
 
 
2075 aa  105  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  29.82 
 
 
536 aa  104  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  25.68 
 
 
3355 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  25.57 
 
 
2868 aa  103  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  26.84 
 
 
2095 aa  103  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  42.61 
 
 
1117 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  28.39 
 
 
548 aa  100  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  40.66 
 
 
1487 aa  99.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  30.65 
 
 
2157 aa  98.2  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  26.32 
 
 
3635 aa  96.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  36.36 
 
 
386 aa  94  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  40.88 
 
 
740 aa  93.2  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  49.45 
 
 
2757 aa  93.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  49.45 
 
 
1916 aa  94  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  33.85 
 
 
1405 aa  92  5e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  27.19 
 
 
1342 aa  91.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  27.56 
 
 
1447 aa  90.9  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  48.35 
 
 
2025 aa  90.1  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  29.07 
 
 
1546 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  48.42 
 
 
977 aa  89.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  27.24 
 
 
1447 aa  89  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  40.24 
 
 
1471 aa  88.6  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  36.9 
 
 
1472 aa  88.6  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  40.24 
 
 
1471 aa  88.6  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  27.4 
 
 
4384 aa  88.6  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  28.7 
 
 
1353 aa  88.2  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  26.99 
 
 
1446 aa  87.8  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  32.58 
 
 
3126 aa  87.8  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  31.12 
 
 
404 aa  87.8  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  39.31 
 
 
715 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  34.36 
 
 
877 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  38.41 
 
 
1854 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  26.7 
 
 
1616 aa  85.5  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  28.54 
 
 
1434 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  25.12 
 
 
597 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  33.77 
 
 
1616 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  33.77 
 
 
1616 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  35.36 
 
 
816 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  35.36 
 
 
831 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  35.36 
 
 
831 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  35.36 
 
 
816 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  35.36 
 
 
820 aa  82.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  35.36 
 
 
816 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  35.36 
 
 
816 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  32.37 
 
 
1613 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  33.19 
 
 
1265 aa  79  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  42.24 
 
 
5143 aa  78.6  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  27.38 
 
 
827 aa  77  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  36.87 
 
 
1674 aa  75.5  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>