195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0228 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  100 
 
 
600 aa  1166    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  74.82 
 
 
691 aa  934    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  41.59 
 
 
595 aa  376  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  37.64 
 
 
572 aa  317  4e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  71.1 
 
 
1230 aa  289  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  50.62 
 
 
1333 aa  261  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  71.26 
 
 
563 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  60.54 
 
 
1065 aa  239  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  65.17 
 
 
565 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  65.88 
 
 
1212 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  77.54 
 
 
998 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  57 
 
 
1411 aa  196  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  56.35 
 
 
1014 aa  195  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  56.22 
 
 
1813 aa  189  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  31.55 
 
 
601 aa  188  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  28.6 
 
 
536 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  38.11 
 
 
404 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  30.4 
 
 
575 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.75 
 
 
1674 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  35.27 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  35.51 
 
 
2866 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  34.94 
 
 
492 aa  123  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  36.75 
 
 
898 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  34.04 
 
 
1549 aa  120  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  33.7 
 
 
2141 aa  120  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  51.26 
 
 
2091 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  48.82 
 
 
2092 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  32.58 
 
 
1588 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  32.58 
 
 
1654 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  50.42 
 
 
2078 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  50.42 
 
 
2073 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  50.42 
 
 
2078 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  53.39 
 
 
2075 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  36.25 
 
 
2493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  34.74 
 
 
1117 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  50.44 
 
 
2728 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  50.44 
 
 
2778 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  50.44 
 
 
2814 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  35.47 
 
 
2505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  35.55 
 
 
2868 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  34.03 
 
 
655 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  29.92 
 
 
1616 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  29.92 
 
 
1616 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  29.92 
 
 
1616 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  37 
 
 
2396 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  31.47 
 
 
1516 aa  102  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  31.39 
 
 
820 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  31.39 
 
 
816 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  33 
 
 
831 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  33 
 
 
831 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  31.39 
 
 
816 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  31.39 
 
 
816 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  31.39 
 
 
816 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  31.46 
 
 
1613 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  50 
 
 
2757 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  33.45 
 
 
589 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  51.46 
 
 
2025 aa  99.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  31.55 
 
 
831 aa  99.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  32.09 
 
 
810 aa  99.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  35.11 
 
 
1471 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  35.11 
 
 
1471 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  33.2 
 
 
1916 aa  98.6  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  35.04 
 
 
1854 aa  98.2  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  50.49 
 
 
1916 aa  97.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  35.14 
 
 
1472 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  31.88 
 
 
1546 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  32.08 
 
 
2392 aa  94.7  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  36.04 
 
 
617 aa  94  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  36.81 
 
 
827 aa  93.6  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  35.68 
 
 
1186 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  34.64 
 
 
2095 aa  91.3  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  38.71 
 
 
1012 aa  90.9  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  44.19 
 
 
740 aa  90.1  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  35.98 
 
 
1074 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  31.89 
 
 
1451 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  35.98 
 
 
1122 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  35.98 
 
 
1090 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  35.98 
 
 
1090 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  35.98 
 
 
1090 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  35.98 
 
 
1122 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  35.98 
 
 
1122 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  37.78 
 
 
1068 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  29.74 
 
 
601 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0011  putative outer membrane protein  32.58 
 
 
279 aa  88.2  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  32.17 
 
 
3635 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  29.74 
 
 
1265 aa  87.8  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  33.8 
 
 
1535 aa  87.4  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  26.02 
 
 
650 aa  87.4  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  33.8 
 
 
1669 aa  87.4  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  44.44 
 
 
766 aa  87.8  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  33.8 
 
 
1626 aa  87.4  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  33.8 
 
 
1705 aa  87  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  33.8 
 
 
1766 aa  87  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  44.55 
 
 
977 aa  87  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  34.83 
 
 
548 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  37.32 
 
 
4726 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  35.16 
 
 
1353 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  33.89 
 
 
715 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  33.58 
 
 
1197 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  27.67 
 
 
1447 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>