137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1334 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  100 
 
 		 565 aa  1106    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  70.73 
 
 		 563 aa  760    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  44.44 
 
 		 1230 aa  280  4e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  68.4 
 
 		 1065 aa  265  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  62.26 
 
 		 1333 aa  262  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  61.9 
 
 		 595 aa  258  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  66.29 
 
 		 1212 aa  246  8e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  65.17 
 
 		 691 aa  236  9e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  65.17 
 
 		 600 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  59.46 
 
 		 572 aa  207  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  52.31 
 
 		 1411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  36.4 
 
 		 601 aa  194  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  58.93 
 
 		 1014 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  62.77 
 
 		 998 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  63.27 
 
 		 1813 aa  171  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  43.57 
 
 		 2078 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  43.57 
 
 		 2078 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  43.57 
 
 		 2073 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  43.57 
 
 		 2091 aa  108  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  32.2 
 
 		 1516 aa  102  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  42.07 
 
 		 2092 aa  100  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  29.29 
 
 		 551 aa  99.4  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  41.38 
 
 		 2075 aa  97.8  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  29.05 
 
 		 599 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  31.16 
 
 		 989 aa  78.2  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  31.58 
 
 		 5143 aa  77  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  26.84 
 
 		 735 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  33.08 
 
 		 1616 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1616 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  33.08 
 
 		 1616 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  26.92 
 
 		 1472 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  28.26 
 
 		 4191 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  31.6 
 
 		 1405 aa  72  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  25.87 
 
 		 1390 aa  71.6  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  33.33 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  33.66 
 
 		 1613 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  31.51 
 
 		 2095 aa  70.5  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.08 
 
 		 1674 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  31.7 
 
 		 2914 aa  70.1  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  29.71 
 
 		 3554 aa  68.6  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  33.33 
 
 		 1588 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  31.02 
 
 		 1440 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  35.45 
 
 		 1259 aa  65.1  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  31.02 
 
 		 1190 aa  65.1  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  26.46 
 
 		 4526 aa  65.1  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  25.96 
 
 		 1447 aa  64.3  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  32.42 
 
 		 597 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  32.42 
 
 		 597 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  34.21 
 
 		 1342 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  26.3 
 
 		 1549 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  34.21 
 
 		 1447 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  34.21 
 
 		 1446 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  32.42 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  25.43 
 
 		 1713 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  41.57 
 
 		 1235 aa  61.2  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  31.5 
 
 		 1487 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  29.03 
 
 		 3718 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  31.22 
 
 		 2392 aa  60.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  42.67 
 
 		 2504 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  30.17 
 
 		 2396 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  28.57 
 
 		 1854 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  25.76 
 
 		 4384 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  31.5 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  62.5 
 
 		 2906 aa  58.2  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  27.44 
 
 		 1434 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  25.24 
 
 		 650 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  30.52 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  25.5 
 
 		 3920 aa  57.4  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  29.86 
 
 		 827 aa  57  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  28.7 
 
 		 2157 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  28.38 
 
 		 2505 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  27.47 
 
 		 1916 aa  56.2  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  27.98 
 
 		 1546 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  28.2 
 
 		 1451 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  27.98 
 
 		 1471 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  27.98 
 
 		 1471 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  28.06 
 
 		 3355 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  29.12 
 
 		 536 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  30.81 
 
 		 1197 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  28.74 
 
 		 3192 aa  53.9  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  30.99 
 
 		 967 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  24.91 
 
 		 2866 aa  53.5  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  27.67 
 
 		 4726 aa  53.5  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  40.54 
 
 		 2025 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  30.99 
 
 		 2868 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  28.73 
 
 		 877 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  31.9 
 
 		 1012 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  27.22 
 
 		 1246 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  23.75 
 
 		 4238 aa  52.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1543  outer membrane protein  39.73 
 
 		 452 aa  52  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.316973  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  30.52 
 
 		 1197 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  30.52 
 
 		 1197 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  30.43 
 
 		 1072 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  40 
 
 		 3078 aa  51.2  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  30.97 
 
 		 876 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1182  YadA domain protein  38.89 
 
 		 224 aa  50.8  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  33.33 
 
 		 2832 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  29.85 
 
 		 3635 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  31.96 
 
 		 1186 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1563  hypothetical protein  39.19 
 
 		 305 aa  50.4  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000159898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>