190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0602 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0602  adhesin  100 
 
 
404 aa  793    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  68.15 
 
 
386 aa  489  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  34.47 
 
 
492 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  38.11 
 
 
600 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  36.73 
 
 
691 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  39.29 
 
 
2814 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  38.3 
 
 
2866 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  31.9 
 
 
1230 aa  104  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  38.39 
 
 
2493 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  40.64 
 
 
1090 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  40.64 
 
 
1074 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  40.64 
 
 
1090 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  40.64 
 
 
1090 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  40.64 
 
 
1122 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  40.64 
 
 
1122 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  36.39 
 
 
2505 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  40.64 
 
 
1122 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  39.29 
 
 
2728 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  40.53 
 
 
536 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  39.29 
 
 
2778 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  38.84 
 
 
898 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  38.7 
 
 
1117 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  30 
 
 
1472 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  34.93 
 
 
1471 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  34.93 
 
 
1471 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  35.91 
 
 
2141 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  32.19 
 
 
617 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  33.89 
 
 
572 aa  88.6  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  34.4 
 
 
1068 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  28.57 
 
 
1411 aa  87.4  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  38.25 
 
 
2396 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  29.68 
 
 
1333 aa  86.7  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  31.35 
 
 
601 aa  86.3  8e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  33.92 
 
 
1012 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  40.24 
 
 
2095 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  32.41 
 
 
1434 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  33.98 
 
 
962 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  33.01 
 
 
1516 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  33.92 
 
 
1654 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  34.67 
 
 
827 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  38.6 
 
 
575 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  37.59 
 
 
3635 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  34.29 
 
 
1186 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  31.98 
 
 
1546 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  32.32 
 
 
1326 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  34.69 
 
 
1854 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  32.56 
 
 
716 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  33.46 
 
 
595 aa  82  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
831 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
831 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
816 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
816 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  31.91 
 
 
1613 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
816 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  31.41 
 
 
737 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
816 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
820 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  35.93 
 
 
2157 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  38.67 
 
 
1487 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  30.27 
 
 
716 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  29.8 
 
 
1265 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  35.51 
 
 
1065 aa  77.8  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  36.6 
 
 
1197 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  36.55 
 
 
1451 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  32.58 
 
 
473 aa  77  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  29.24 
 
 
650 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  31 
 
 
1674 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  36.6 
 
 
1197 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  36.6 
 
 
1197 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  35.69 
 
 
1353 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  42.34 
 
 
740 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  51.85 
 
 
4384 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.46 
 
 
1588 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  42.34 
 
 
766 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  42.86 
 
 
977 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  35.63 
 
 
1916 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  36.72 
 
 
877 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  29.03 
 
 
589 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  29.84 
 
 
810 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.04 
 
 
1549 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  32.6 
 
 
655 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  27.41 
 
 
1190 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  30 
 
 
1616 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  30 
 
 
1616 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  27.41 
 
 
1440 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  30 
 
 
1616 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  31.82 
 
 
3192 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0011  putative outer membrane protein  37.89 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  32.15 
 
 
1212 aa  69.7  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  31.4 
 
 
2832 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  32.13 
 
 
2092 aa  69.7  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  32.84 
 
 
831 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  33.22 
 
 
2392 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  35.69 
 
 
1125 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  32.04 
 
 
597 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  31.21 
 
 
4191 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  35.69 
 
 
1204 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  32.04 
 
 
597 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  28.57 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  33.47 
 
 
2091 aa  68.2  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>