164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1482 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  100 
 
 
595 aa  1152    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  75.83 
 
 
572 aa  834    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  40.73 
 
 
600 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  56.53 
 
 
1212 aa  372  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  41.84 
 
 
691 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  50.13 
 
 
1065 aa  301  2e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  50.57 
 
 
1411 aa  298  2e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  46.45 
 
 
1230 aa  280  4e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  58.3 
 
 
1333 aa  277  5e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  61.9 
 
 
565 aa  257  4e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  31.97 
 
 
601 aa  200  5e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  63.64 
 
 
1014 aa  185  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  62.41 
 
 
1813 aa  182  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  65.22 
 
 
998 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  31.16 
 
 
1916 aa  144  6e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  30.82 
 
 
536 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  39.61 
 
 
2814 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  40.71 
 
 
898 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  39.72 
 
 
2078 aa  111  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  39.72 
 
 
2073 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  39.72 
 
 
2078 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  39.72 
 
 
2091 aa  109  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  39.61 
 
 
2728 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  39.61 
 
 
2778 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  40.14 
 
 
2092 aa  105  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  41.29 
 
 
2505 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  39.49 
 
 
1117 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  29.38 
 
 
2866 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  38.43 
 
 
2493 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  39.44 
 
 
2075 aa  102  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  39.9 
 
 
575 aa  93.6  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  39.22 
 
 
1654 aa  90.1  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  37.55 
 
 
2396 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  32.25 
 
 
492 aa  88.6  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  36.47 
 
 
4384 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  32.7 
 
 
1814 aa  87.8  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  29.77 
 
 
1674 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  34.84 
 
 
3635 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  28.39 
 
 
1342 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  36.4 
 
 
589 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.53 
 
 
1549 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  32.02 
 
 
1616 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  34.25 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  34.4 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  32.02 
 
 
1616 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  28.64 
 
 
1447 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  28.13 
 
 
1447 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  28.64 
 
 
1446 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  33.57 
 
 
2157 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  34.32 
 
 
2392 aa  80.9  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  32.44 
 
 
1516 aa  80.5  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  38.36 
 
 
2095 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  40.58 
 
 
766 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  35.27 
 
 
1487 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  39.86 
 
 
740 aa  78.2  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.98 
 
 
1588 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  28.13 
 
 
1472 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  45.19 
 
 
2025 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  45.71 
 
 
2757 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  33.66 
 
 
3737 aa  76.6  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  33.48 
 
 
2868 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  45.71 
 
 
1916 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  36.89 
 
 
4726 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  34.96 
 
 
601 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  35.74 
 
 
1535 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  50 
 
 
977 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  35.74 
 
 
1705 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  35.74 
 
 
1669 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  35.74 
 
 
1766 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  35.74 
 
 
1626 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  33.72 
 
 
1613 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
831 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
831 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  30.79 
 
 
1265 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
820 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  41.57 
 
 
715 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
816 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  33.06 
 
 
1122 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  33.06 
 
 
1090 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  33.06 
 
 
1074 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
816 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  33.06 
 
 
1090 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  33.06 
 
 
1090 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  33.06 
 
 
1122 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  33.06 
 
 
1122 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
816 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  31.94 
 
 
816 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  30.14 
 
 
655 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  31.75 
 
 
2141 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  30.9 
 
 
1405 aa  71.6  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  29.54 
 
 
1616 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  36.65 
 
 
1854 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  39.88 
 
 
1471 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  39.88 
 
 
1471 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  29.84 
 
 
5143 aa  67.4  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  33.02 
 
 
548 aa  67  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  35.79 
 
 
735 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  39.26 
 
 
1546 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  30.5 
 
 
4191 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  46.75 
 
 
597 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>