186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1085 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0383  large adhesin  50.19 
 
 
4238 aa  1307    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  100 
 
 
3737 aa  7451    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  49.58 
 
 
2914 aa  1023    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  49.08 
 
 
3920 aa  630  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  61.77 
 
 
3078 aa  613  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  46.4 
 
 
4526 aa  531  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  54.9 
 
 
5143 aa  456  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  31.8 
 
 
3554 aa  400  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  43.99 
 
 
2906 aa  323  5e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  41.35 
 
 
2851 aa  302  7e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  32.94 
 
 
2078 aa  265  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  31.41 
 
 
2075 aa  253  7e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  31.3 
 
 
2073 aa  249  4.9999999999999997e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  30.88 
 
 
1813 aa  249  6e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  31.87 
 
 
2078 aa  220  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  37.8 
 
 
209 aa  133  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  32.3 
 
 
2092 aa  110  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  29.02 
 
 
2868 aa  108  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  31.57 
 
 
827 aa  108  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  31.05 
 
 
1014 aa  99  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  32.58 
 
 
1068 aa  96.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  38.46 
 
 
2091 aa  95.9  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  30.31 
 
 
1186 aa  95.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  26.39 
 
 
1411 aa  95.9  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  29.06 
 
 
617 aa  94.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  30.4 
 
 
1212 aa  91.7  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  31.46 
 
 
1012 aa  89.4  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  30.16 
 
 
1616 aa  89  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  29.89 
 
 
1616 aa  87.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  29.89 
 
 
1616 aa  87.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  28.57 
 
 
1230 aa  87.4  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  34.62 
 
 
1342 aa  87  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  34.62 
 
 
1472 aa  86.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  34.62 
 
 
1447 aa  86.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  34.62 
 
 
1446 aa  86.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  34.62 
 
 
1447 aa  86.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  37.4 
 
 
1588 aa  85.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  36.59 
 
 
279 aa  84  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  26.9 
 
 
4191 aa  83.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  36.59 
 
 
1674 aa  83.2  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  36.59 
 
 
1549 aa  83.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  31.9 
 
 
2396 aa  82.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  29.83 
 
 
962 aa  81.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  32.5 
 
 
1405 aa  80.9  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  27.6 
 
 
1072 aa  80.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  27.49 
 
 
2095 aa  79.7  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  27.75 
 
 
1516 aa  79.3  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  30.49 
 
 
998 aa  79.3  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  47.47 
 
 
356 aa  78.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  27.03 
 
 
650 aa  77  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  39.56 
 
 
877 aa  76.3  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  28.14 
 
 
3718 aa  75.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  29.8 
 
 
1259 aa  75.1  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  29.79 
 
 
691 aa  75.5  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  31.75 
 
 
1451 aa  74.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  32.16 
 
 
2866 aa  74.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  29.36 
 
 
1333 aa  74.7  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  27.88 
 
 
737 aa  74.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  33.02 
 
 
2493 aa  74.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  39.56 
 
 
810 aa  74.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  26.33 
 
 
3635 aa  73.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  32.38 
 
 
2814 aa  73.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  28.74 
 
 
4726 aa  73.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  39.36 
 
 
716 aa  73.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  44.04 
 
 
1440 aa  73.2  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  33.17 
 
 
595 aa  73.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  43.12 
 
 
1190 aa  71.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  33.17 
 
 
536 aa  71.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  39.36 
 
 
716 aa  71.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  32.06 
 
 
1613 aa  71.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  27.1 
 
 
600 aa  71.6  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  25.62 
 
 
599 aa  71.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  33.67 
 
 
898 aa  70.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  27.07 
 
 
601 aa  70.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  26.08 
 
 
1117 aa  70.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  26.1 
 
 
735 aa  70.1  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  32.83 
 
 
4384 aa  69.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  40.66 
 
 
492 aa  68.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  33.17 
 
 
2728 aa  68.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  33.17 
 
 
2778 aa  68.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  32.23 
 
 
597 aa  67.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  32.23 
 
 
597 aa  67.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  32.23 
 
 
597 aa  67.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  27.83 
 
 
551 aa  67  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  36.04 
 
 
1713 aa  67  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  37.3 
 
 
3126 aa  67  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  29.15 
 
 
831 aa  67  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  29.15 
 
 
831 aa  67  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  42.53 
 
 
472 aa  66.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  30.16 
 
 
1204 aa  66.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  30.16 
 
 
1125 aa  66.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  33.49 
 
 
575 aa  66.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  29.15 
 
 
820 aa  66.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  29.15 
 
 
816 aa  66.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  29.15 
 
 
816 aa  66.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  29.15 
 
 
816 aa  66.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  29.15 
 
 
816 aa  66.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  40.19 
 
 
2504 aa  65.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  40.19 
 
 
1390 aa  65.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  38.46 
 
 
589 aa  65.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>