More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0227 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  75.62 
 
 
2078 aa  2989    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  75.07 
 
 
2073 aa  2917    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  84.51 
 
 
2091 aa  3375    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  76.16 
 
 
2078 aa  2992    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  79.52 
 
 
2075 aa  3137    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  67.4 
 
 
1813 aa  1382    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  71.75 
 
 
1014 aa  1137    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  100 
 
 
2092 aa  4085    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  36.44 
 
 
3554 aa  419  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  70.11 
 
 
1411 aa  325  5e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  73.63 
 
 
209 aa  287  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  59.32 
 
 
601 aa  274  1e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  29.54 
 
 
2906 aa  255  8.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  33.19 
 
 
2914 aa  243  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  28.77 
 
 
4238 aa  206  6e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  37.27 
 
 
3920 aa  189  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  28.02 
 
 
5143 aa  154  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  42.34 
 
 
998 aa  148  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  31.55 
 
 
2851 aa  139  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  48.18 
 
 
1230 aa  126  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  48.82 
 
 
600 aa  119  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  50.43 
 
 
691 aa  118  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  29.08 
 
 
3078 aa  118  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  45.59 
 
 
1333 aa  115  7.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  45.52 
 
 
563 aa  112  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  45.52 
 
 
1065 aa  108  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  48.46 
 
 
4526 aa  107  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  40.14 
 
 
595 aa  105  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  47.22 
 
 
1212 aa  105  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  42.07 
 
 
565 aa  100  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  29.47 
 
 
2095 aa  100  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  41.91 
 
 
572 aa  99  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  26.15 
 
 
827 aa  97.1  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  38.46 
 
 
3737 aa  95.9  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  29.44 
 
 
4384 aa  95.9  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  32.52 
 
 
367 aa  94  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  31.66 
 
 
314 aa  92.8  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  26.77 
 
 
1068 aa  89  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  25.38 
 
 
617 aa  88.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  25.67 
 
 
1125 aa  88.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  27.25 
 
 
2868 aa  87  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  27.74 
 
 
1012 aa  83.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  27.88 
 
 
4726 aa  82.8  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  27.29 
 
 
962 aa  82.8  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  24.89 
 
 
1516 aa  81.6  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  26.76 
 
 
737 aa  80.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  30 
 
 
1259 aa  80.5  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  32.27 
 
 
1405 aa  79.7  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  29.11 
 
 
1451 aa  79  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  31.69 
 
 
4191 aa  78.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  34.03 
 
 
1549 aa  77.4  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  26.27 
 
 
963 aa  76.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  31.7 
 
 
877 aa  75.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  28.54 
 
 
1190 aa  74.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  24.97 
 
 
3126 aa  73.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.97 
 
 
1674 aa  73.2  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  27.64 
 
 
2832 aa  70.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  33.97 
 
 
1440 aa  70.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  48 
 
 
1390 aa  70.1  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  45.45 
 
 
2504 aa  70.1  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  31.46 
 
 
386 aa  70.1  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  32.13 
 
 
404 aa  70.1  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  29.28 
 
 
1186 aa  69.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  32.14 
 
 
575 aa  69.3  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  45.05 
 
 
1235 aa  68.6  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  31.8 
 
 
1072 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  37.25 
 
 
551 aa  67.8  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  30.57 
 
 
3718 aa  67  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  29.73 
 
 
650 aa  67  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  48.42 
 
 
1613 aa  66.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  37.11 
 
 
1246 aa  66.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  30.18 
 
 
3635 aa  65.9  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  32.19 
 
 
1326 aa  65.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  24.03 
 
 
735 aa  65.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0175  hypothetical protein  55.56 
 
 
52 aa  62.8  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  40 
 
 
597 aa  62.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  40 
 
 
597 aa  62.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  40 
 
 
597 aa  62.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  33.79 
 
 
990 aa  62.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  24.78 
 
 
2396 aa  60.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  24.21 
 
 
536 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  46.58 
 
 
330 aa  60.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  33.85 
 
 
1916 aa  60.1  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  43.37 
 
 
3355 aa  59.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  36.46 
 
 
1713 aa  59.3  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  32.28 
 
 
270 aa  58.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  28.07 
 
 
601 aa  58.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  26.02 
 
 
3192 aa  57.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  30.99 
 
 
2814 aa  57.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  31.1 
 
 
548 aa  57  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  26.9 
 
 
1471 aa  57.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  26.9 
 
 
1471 aa  57.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  34.96 
 
 
221 aa  57  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  34.96 
 
 
221 aa  57  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  34.96 
 
 
221 aa  57  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  30.81 
 
 
270 aa  56.6  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  31.3 
 
 
418 aa  56.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  37.5 
 
 
270 aa  56.6  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  30.99 
 
 
2728 aa  56.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  30.99 
 
 
2778 aa  56.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>