201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0992 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  100 
 
 
1190 aa  2313    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  58.61 
 
 
2504 aa  932    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  58.83 
 
 
1390 aa  938    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  94.62 
 
 
1440 aa  1573    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  38.21 
 
 
1259 aa  295  3e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  47.84 
 
 
876 aa  275  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  46.36 
 
 
716 aa  275  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  48.08 
 
 
880 aa  275  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  45.87 
 
 
716 aa  270  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  47.61 
 
 
878 aa  257  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  41.22 
 
 
831 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  41.22 
 
 
831 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  41.22 
 
 
816 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  41.22 
 
 
820 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  41.22 
 
 
816 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  41.22 
 
 
816 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  41.22 
 
 
816 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  44.57 
 
 
1326 aa  202  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  41.51 
 
 
831 aa  197  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  32.42 
 
 
1713 aa  191  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  33.15 
 
 
1446 aa  184  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  33.53 
 
 
1472 aa  183  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  38.38 
 
 
877 aa  181  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  36.02 
 
 
2095 aa  179  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  33.2 
 
 
1447 aa  179  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  33.2 
 
 
1342 aa  178  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  33.2 
 
 
1447 aa  178  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  33.78 
 
 
740 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  47.56 
 
 
472 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  32.8 
 
 
1616 aa  176  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  53.45 
 
 
597 aa  174  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  32.62 
 
 
1588 aa  172  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  32.08 
 
 
1616 aa  172  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  32.08 
 
 
1616 aa  172  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  52.87 
 
 
597 aa  171  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  52.87 
 
 
597 aa  171  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  35.43 
 
 
2396 aa  171  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  30.55 
 
 
1674 aa  170  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  44.86 
 
 
810 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  32.52 
 
 
1549 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  41.73 
 
 
330 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  33.68 
 
 
766 aa  161  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  37.02 
 
 
536 aa  158  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  37.44 
 
 
1197 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  37.44 
 
 
1197 aa  155  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  37.44 
 
 
1197 aa  155  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  36.46 
 
 
1204 aa  153  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  36.46 
 
 
1125 aa  152  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  52.98 
 
 
1451 aa  149  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  50.56 
 
 
423 aa  146  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  49.43 
 
 
575 aa  144  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  47.06 
 
 
356 aa  140  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  47.16 
 
 
589 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  34.44 
 
 
1471 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  39.53 
 
 
655 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  34.44 
 
 
1471 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  34.44 
 
 
1546 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  37.33 
 
 
279 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  41.15 
 
 
1417 aa  129  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  38.55 
 
 
4384 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  35.16 
 
 
1854 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  41.85 
 
 
3126 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  39.59 
 
 
2832 aa  128  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  37.54 
 
 
1072 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  38.31 
 
 
3192 aa  126  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  34.29 
 
 
1353 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  31.21 
 
 
1068 aa  122  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  41.74 
 
 
2868 aa  119  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  31.07 
 
 
962 aa  118  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  45.93 
 
 
967 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  27.97 
 
 
2157 aa  116  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  36.86 
 
 
1309 aa  115  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  27.42 
 
 
3635 aa  115  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  30.83 
 
 
1012 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  32.92 
 
 
492 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  31.46 
 
 
1122 aa  112  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  30.18 
 
 
1916 aa  111  8.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  39.44 
 
 
990 aa  110  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  42.19 
 
 
1186 aa  109  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  37.41 
 
 
735 aa  107  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  38.03 
 
 
1516 aa  107  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  37.5 
 
 
998 aa  106  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  37.09 
 
 
3355 aa  105  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  36.62 
 
 
2141 aa  104  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  27.62 
 
 
4191 aa  102  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  41.57 
 
 
373 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  41.57 
 
 
373 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  41.57 
 
 
378 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  41.57 
 
 
192 aa  100  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  41.57 
 
 
192 aa  100  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  39.89 
 
 
378 aa  99.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  38.4 
 
 
4726 aa  99.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  39.89 
 
 
460 aa  99.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  48.68 
 
 
898 aa  98.6  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  39.25 
 
 
533 aa  98.2  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  38 
 
 
1405 aa  96.7  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  31.06 
 
 
963 aa  95.9  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  37.56 
 
 
525 aa  95.5  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  42.13 
 
 
2392 aa  94.7  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  41.18 
 
 
3718 aa  93.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>