196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2908 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  100 
 
 
3192 aa  6008    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  54.37 
 
 
2832 aa  1658    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  39.52 
 
 
3126 aa  855    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  32.16 
 
 
4191 aa  582  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  33.35 
 
 
2868 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  36.42 
 
 
3355 aa  342  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  43.48 
 
 
735 aa  324  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  34.88 
 
 
3635 aa  255  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  50.67 
 
 
1246 aa  246  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  37.64 
 
 
1309 aa  235  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  32.54 
 
 
963 aa  230  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  31.95 
 
 
1613 aa  215  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  37.94 
 
 
4726 aa  214  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  31.02 
 
 
1125 aa  214  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  29.54 
 
 
1447 aa  211  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  30.22 
 
 
1451 aa  210  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  32.19 
 
 
1072 aa  198  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  30.37 
 
 
1197 aa  196  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  30.24 
 
 
1197 aa  195  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  30.24 
 
 
1197 aa  195  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  29.02 
 
 
1342 aa  190  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  36.69 
 
 
3718 aa  189  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  31.3 
 
 
1204 aa  186  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  34.9 
 
 
597 aa  185  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  34.68 
 
 
597 aa  182  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  34.68 
 
 
597 aa  182  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  31.53 
 
 
1117 aa  179  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  36.82 
 
 
877 aa  178  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  31.1 
 
 
990 aa  176  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  37.03 
 
 
967 aa  175  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  28.41 
 
 
1616 aa  174  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  28.41 
 
 
1616 aa  174  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  34.84 
 
 
1417 aa  173  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  33.83 
 
 
1713 aa  173  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  32.65 
 
 
1326 aa  172  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  28.9 
 
 
1472 aa  167  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  29.45 
 
 
1446 aa  161  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  36.44 
 
 
2157 aa  158  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  32.99 
 
 
1447 aa  153  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  34.47 
 
 
1074 aa  152  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  34.04 
 
 
1122 aa  152  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  29.78 
 
 
1616 aa  151  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  34.25 
 
 
1090 aa  150  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  39.12 
 
 
810 aa  150  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  33.89 
 
 
1122 aa  150  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  34.25 
 
 
1090 aa  150  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  34.25 
 
 
1090 aa  150  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  34.04 
 
 
1122 aa  150  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  29.66 
 
 
1588 aa  149  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  31.26 
 
 
880 aa  148  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.85 
 
 
1674 aa  147  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  31.09 
 
 
876 aa  146  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  30.42 
 
 
1440 aa  142  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  30.7 
 
 
1190 aa  142  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  30.28 
 
 
878 aa  129  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  39.71 
 
 
655 aa  128  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  48.35 
 
 
1012 aa  125  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  48.11 
 
 
1068 aa  125  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  29.03 
 
 
1549 aa  125  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  48.35 
 
 
1186 aa  124  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  47.8 
 
 
962 aa  123  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  36.73 
 
 
536 aa  118  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  32.63 
 
 
816 aa  117  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  41.12 
 
 
533 aa  117  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  32.43 
 
 
820 aa  117  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  32.43 
 
 
831 aa  116  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  32.43 
 
 
831 aa  116  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  32.43 
 
 
816 aa  116  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  32.43 
 
 
816 aa  116  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  32.43 
 
 
816 aa  116  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  48.68 
 
 
617 aa  116  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  36.34 
 
 
2141 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  31.65 
 
 
716 aa  115  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  30.18 
 
 
740 aa  114  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  33.59 
 
 
831 aa  115  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  30.82 
 
 
753 aa  115  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  36.52 
 
 
472 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  31.83 
 
 
716 aa  113  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  38.7 
 
 
373 aa  113  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  38.41 
 
 
977 aa  113  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  38.93 
 
 
330 aa  113  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  38.7 
 
 
378 aa  113  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  38.7 
 
 
373 aa  113  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  52.97 
 
 
4384 aa  112  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  34.33 
 
 
1390 aa  110  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  38.3 
 
 
2396 aa  110  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  31.47 
 
 
1854 aa  110  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  34.82 
 
 
766 aa  109  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  35.74 
 
 
589 aa  108  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  43.65 
 
 
827 aa  109  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  39 
 
 
378 aa  108  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  30.78 
 
 
1471 aa  108  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  30.78 
 
 
1471 aa  108  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  41.15 
 
 
192 aa  108  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  41.15 
 
 
192 aa  108  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3593  YadA domain protein  36.47 
 
 
742 aa  107  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50488  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 
575 aa  106  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  38.7 
 
 
473 aa  106  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  29.07 
 
 
2504 aa  105  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  39 
 
 
460 aa  105  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>