200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1526 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  100 
 
 
735 aa  1394    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  45.86 
 
 
2832 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  49.53 
 
 
3126 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  43.11 
 
 
4726 aa  330  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  45.01 
 
 
3192 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  47.97 
 
 
3635 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  44.23 
 
 
4384 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  44.23 
 
 
877 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  39.22 
 
 
810 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  41.67 
 
 
1309 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  34.99 
 
 
3718 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  42.09 
 
 
2868 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  35.88 
 
 
1451 aa  197  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  36.17 
 
 
1197 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  36.17 
 
 
1197 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  36.17 
 
 
1197 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  34.86 
 
 
1125 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  34.86 
 
 
1204 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  34.2 
 
 
1613 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  34.43 
 
 
597 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  34.05 
 
 
597 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  34.05 
 
 
597 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  47.53 
 
 
990 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  41.78 
 
 
472 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  32.51 
 
 
1072 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  40.79 
 
 
1713 aa  156  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  34.64 
 
 
1326 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  34.81 
 
 
963 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  33.28 
 
 
716 aa  153  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  33.11 
 
 
716 aa  150  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  30.37 
 
 
4191 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  39.27 
 
 
1246 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  35.25 
 
 
536 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  34.96 
 
 
880 aa  143  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  33.63 
 
 
3355 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  34.71 
 
 
876 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  31.66 
 
 
1616 aa  141  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  31.6 
 
 
1588 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  29.88 
 
 
1674 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  37.5 
 
 
2157 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  30.1 
 
 
878 aa  137  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  31.27 
 
 
1549 aa  137  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  35.62 
 
 
575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  33.79 
 
 
1814 aa  135  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  37.5 
 
 
589 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  30.8 
 
 
1616 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  30.8 
 
 
1616 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  34.54 
 
 
1472 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  30.3 
 
 
1447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  30.3 
 
 
1342 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  30.3 
 
 
1447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  29.53 
 
 
753 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  33.97 
 
 
1090 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  33.85 
 
 
1074 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  33.97 
 
 
1122 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  33.97 
 
 
1090 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  33.97 
 
 
1090 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  33.97 
 
 
1122 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  33.97 
 
 
1122 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  40.06 
 
 
2392 aa  127  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  38.28 
 
 
1446 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  35.68 
 
 
548 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  31.5 
 
 
1117 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  35.55 
 
 
816 aa  121  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  35.61 
 
 
820 aa  121  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  35.55 
 
 
816 aa  121  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  35.55 
 
 
816 aa  121  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  35.55 
 
 
831 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  35.55 
 
 
831 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  36.06 
 
 
816 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  35 
 
 
279 aa  120  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  34.85 
 
 
831 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  33.06 
 
 
655 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  36.36 
 
 
740 aa  116  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  38.64 
 
 
1440 aa  115  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  38.64 
 
 
1190 aa  115  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  36.04 
 
 
766 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  37.9 
 
 
1417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  31.73 
 
 
1854 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  37.5 
 
 
1390 aa  110  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  53.33 
 
 
1265 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  36.69 
 
 
2504 aa  107  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  30 
 
 
737 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  25.47 
 
 
1516 aa  107  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  41.43 
 
 
1012 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  42.93 
 
 
1068 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  41.43 
 
 
962 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  29.8 
 
 
989 aa  105  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  41.43 
 
 
1186 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  38.66 
 
 
373 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  44.67 
 
 
533 aa  105  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  40.85 
 
 
715 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  38.66 
 
 
373 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  42.49 
 
 
1654 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  40.85 
 
 
1705 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  38.66 
 
 
378 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  40.85 
 
 
1669 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  40.85 
 
 
1766 aa  104  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  40.85 
 
 
1535 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  40.85 
 
 
1626 aa  104  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>