196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2315 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  100 
 
 
1713 aa  3264    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  44.9 
 
 
1616 aa  280  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  44.9 
 
 
1674 aa  280  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  44.9 
 
 
1616 aa  280  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  44.88 
 
 
1549 aa  276  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  43.9 
 
 
1588 aa  268  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  43.9 
 
 
1616 aa  268  8.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  41.71 
 
 
1447 aa  261  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  41.71 
 
 
1342 aa  261  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  41.71 
 
 
1447 aa  261  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  41.71 
 
 
1446 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  47.16 
 
 
279 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  40.28 
 
 
716 aa  218  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  40.28 
 
 
716 aa  215  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  40.14 
 
 
880 aa  215  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  39.91 
 
 
876 aa  213  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  32.3 
 
 
2396 aa  211  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  32 
 
 
1440 aa  202  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  31.87 
 
 
1190 aa  201  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  32.2 
 
 
3126 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  39.03 
 
 
878 aa  189  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  41.08 
 
 
1117 aa  183  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  32.18 
 
 
2832 aa  179  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  37.04 
 
 
2504 aa  176  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  35.28 
 
 
831 aa  173  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  35.28 
 
 
831 aa  173  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  35.28 
 
 
816 aa  173  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  35.28 
 
 
816 aa  172  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  35.28 
 
 
820 aa  172  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  35.28 
 
 
816 aa  172  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  35.28 
 
 
816 aa  172  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  30.38 
 
 
3635 aa  172  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  35.28 
 
 
831 aa  172  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  32.9 
 
 
3192 aa  171  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  37.04 
 
 
1390 aa  168  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  42.41 
 
 
735 aa  168  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  39.3 
 
 
330 aa  165  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  33.84 
 
 
472 aa  161  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  39.03 
 
 
4726 aa  159  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  38.85 
 
 
1326 aa  157  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  29.65 
 
 
753 aa  153  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  31.37 
 
 
877 aa  147  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  28 
 
 
1125 aa  141  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  37.54 
 
 
810 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  33.18 
 
 
1417 aa  133  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  36.15 
 
 
597 aa  133  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  28.67 
 
 
740 aa  132  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  29.28 
 
 
766 aa  132  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  37.64 
 
 
597 aa  131  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  37.64 
 
 
597 aa  131  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  41.6 
 
 
1854 aa  125  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  33.01 
 
 
1197 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  33.01 
 
 
1197 aa  122  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  33.01 
 
 
1197 aa  122  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  36.77 
 
 
1204 aa  120  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  36.77 
 
 
1451 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  30.16 
 
 
1090 aa  119  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  30.16 
 
 
1090 aa  119  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  30.16 
 
 
1090 aa  119  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  30.16 
 
 
1122 aa  118  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  30.16 
 
 
1074 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  30.16 
 
 
1122 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  30.41 
 
 
2392 aa  116  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  30 
 
 
1122 aa  116  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  28.55 
 
 
1246 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  41.24 
 
 
990 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  37.55 
 
 
536 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  39.74 
 
 
423 aa  113  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  30.75 
 
 
4384 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  44.54 
 
 
1309 aa  111  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  28.33 
 
 
963 aa  109  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  36.25 
 
 
356 aa  108  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  42.37 
 
 
1546 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  34.35 
 
 
1072 aa  105  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  32.36 
 
 
4191 aa  104  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  33.52 
 
 
3718 aa  103  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  32.17 
 
 
1434 aa  103  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  35.98 
 
 
2157 aa  102  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  35.06 
 
 
589 aa  101  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  39 
 
 
2868 aa  100  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  30.02 
 
 
655 aa  99.8  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  29.84 
 
 
575 aa  96.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  46.03 
 
 
898 aa  95.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  34.78 
 
 
967 aa  93.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  40 
 
 
3355 aa  90.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  34.26 
 
 
548 aa  89.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  33.85 
 
 
492 aa  88.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  24.95 
 
 
1259 aa  87  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  61.36 
 
 
962 aa  85.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  62.07 
 
 
1012 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  62.07 
 
 
1068 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  58.67 
 
 
1472 aa  84.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  38.13 
 
 
2095 aa  84  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  62.07 
 
 
1186 aa  83.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  29.31 
 
 
563 aa  80.9  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  33 
 
 
2493 aa  80.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  47.93 
 
 
1613 aa  79.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  30.66 
 
 
1516 aa  79  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  32.99 
 
 
1235 aa  78.6  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  30.67 
 
 
373 aa  78.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>