195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5846 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  100 
 
 
492 aa  947    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  68.07 
 
 
1487 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  42.09 
 
 
2157 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  42.33 
 
 
1122 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  42.33 
 
 
1090 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  42.33 
 
 
1090 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  42.33 
 
 
1090 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  42.33 
 
 
1122 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  42.33 
 
 
1122 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  42.81 
 
 
1074 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  40.96 
 
 
816 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  40.69 
 
 
816 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  40.05 
 
 
820 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  40.69 
 
 
816 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  40.69 
 
 
816 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  40.69 
 
 
831 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  40.69 
 
 
831 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  46.15 
 
 
1916 aa  152  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  40.71 
 
 
831 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  34.83 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  50.66 
 
 
877 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  49.22 
 
 
2505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  50.33 
 
 
810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  31.97 
 
 
1230 aa  124  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  40.38 
 
 
2141 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  34.94 
 
 
600 aa  123  8e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  31.55 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  37.36 
 
 
472 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  35.93 
 
 
1854 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  40.66 
 
 
330 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  35.76 
 
 
1117 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  37.83 
 
 
599 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  33.23 
 
 
1333 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  41.53 
 
 
2866 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  38.44 
 
 
2493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  33.58 
 
 
2504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  34.39 
 
 
1654 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  32.92 
 
 
1190 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  41.08 
 
 
1471 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  41.08 
 
 
1471 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  33.17 
 
 
1440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  33.58 
 
 
536 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  35.77 
 
 
1546 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  33.08 
 
 
1390 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  34.33 
 
 
1212 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  39.88 
 
 
1516 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 
575 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  32.26 
 
 
1411 aa  107  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  36.4 
 
 
597 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  36.4 
 
 
597 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  39.42 
 
 
2396 aa  106  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  35.96 
 
 
597 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  32.05 
 
 
691 aa  104  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  35.99 
 
 
1616 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  38.97 
 
 
2814 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  49.01 
 
 
898 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  41.44 
 
 
1353 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  33.05 
 
 
1549 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  30.63 
 
 
1472 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  38.82 
 
 
2095 aa  100  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  34.65 
 
 
1766 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  34.65 
 
 
1535 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  34.65 
 
 
1669 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  48.7 
 
 
423 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  38.71 
 
 
1626 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  37.3 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  36.41 
 
 
1068 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  30.86 
 
 
1447 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  30.86 
 
 
1447 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  30.34 
 
 
1446 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  34.38 
 
 
1705 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  40.17 
 
 
827 aa  97.8  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  32.54 
 
 
655 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  30.65 
 
 
1342 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  35.16 
 
 
1012 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  43.24 
 
 
1451 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  32.42 
 
 
1616 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  43.62 
 
 
1197 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  36.53 
 
 
1065 aa  95.5  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  32.42 
 
 
1616 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  43.62 
 
 
1197 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  33.95 
 
 
1417 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  42.01 
 
 
715 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  43.62 
 
 
1197 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  31.25 
 
 
589 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  42.57 
 
 
1125 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  28.31 
 
 
1588 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  45.19 
 
 
740 aa  90.5  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  34.67 
 
 
1674 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  36.19 
 
 
962 aa  90.1  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  32.99 
 
 
963 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  41.22 
 
 
1204 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  40 
 
 
716 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  30.95 
 
 
595 aa  87.8  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  36.73 
 
 
3920 aa  87.8  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  36.14 
 
 
279 aa  87.4  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  33.85 
 
 
1713 aa  87.4  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  44.44 
 
 
766 aa  87  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  39.33 
 
 
716 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1563  hypothetical protein  43.64 
 
 
305 aa  85.9  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000159898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>